More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1410 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  100 
 
 		 136 aa  276  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  49.21 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  53.91 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  52.68 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  61.22 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  61.22 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  54.78 
 
 		 132 aa  123  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  52.59 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  60.2 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  56.52 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  48.67 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  61.18 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  61.18 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  61.18 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  58.24 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  52.13 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  37.39 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  47.06 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.11 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  36.13 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  50.67 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.53 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  48.57 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  47.14 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  33.02 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  36.72 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 216 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  45.71 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  41.67 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.26 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  40 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  38.39 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  47.5 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  45.07 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 144 aa  66.6  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  47.3 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  41.98 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  41.98 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  41.98 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  41.98 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  41.98 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  41.98 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  41.98 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  40.82 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  43.96 
 
 		 361 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  40.74 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  37.07 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  43.18 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.84 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  41.43 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  39.51 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.13 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  37.93 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  37.17 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  38.52 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  35.96 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  42.5 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.73 
 
 		 393 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 471 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  41.03 
 
 		 229 aa  60.1  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  32.56 
 
 		 320 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  35.44 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  38.96 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.76 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.85 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  35.44 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.96 
 
 		 560 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.5 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  35.44 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>