90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2003 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2003  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 207 aa  431  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.323498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40.22 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.474073  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  30.11 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  25.64 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  32.19 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  25.93 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  24.87 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1591  conjugal transfer protein  29.07 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0975326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  38.3 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  24.6 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  30.71 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0834  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  26.22 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  25.61 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 408 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 404 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5196  Lytic transglycosylase catalytic  36.59 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1531  Lytic transglycosylase catalytic  36.59 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 404 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 408 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 407 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5883  lytic transglycosylase, catalytic  44.07 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.161206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  42.11 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5666  lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326026  hitchhiker  0.0069947 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  28.72 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  31.53 
 
 		 599 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  36.71 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  29.35 
 
 		 164 aa  51.6  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  26.87 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  41.33 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  27.59 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_23  transglycosylase PilT  25.73 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.846222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  23.9 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  36.9 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  38.27 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  26.83 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05356  putative lipoprotein  45.76 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.592846  normal  0.453874 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  43.08 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  31.18 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  31.18 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  31.18 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  31.18 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  31.18 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  27.94 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  36.67 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  35.06 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  36.59 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6789  lytic transglycosylase, catalytic  30.86 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  35.53 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  43.86 
 
 		 170 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  34.15 
 
 		 164 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  37.29 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  34.15 
 
 		 164 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  38.33 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  35.59 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  35.59 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  31.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  35.59 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  35.59 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  35.59 
 
 		 187 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  38.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  37.29 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  38.33 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  37.29 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4125  lytic transglycosylase PilT  27.33 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476698 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  38.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  38.33 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  38.33 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  38.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  37.29 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6234  lytic transglycosylase catalytic  28.83 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  37.29 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  23.7 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  38.33 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  36.67 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2772  Lytic transglycosylase catalytic  40.35 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  27.44 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3138  Lytic transglycosylase catalytic  40.35 
 
 		 157 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.82617  normal  0.443685 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0005  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.37 
 
 		 168 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1033  Lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 237 aa  42  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  28.43 
 
 		 251 aa  41.6  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0043  lytic transglycosylase  31.46 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>