125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0043 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0043  lytic transglycosylase  100 
 
 		 215 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  38.85 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0111  lytic transglycosylase PilT  44.76 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0042  pilT protein  39.85 
 
 		 163 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0049  pilT protein, putative  39.85 
 
 		 150 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4280  lytic transglycosylase, catalytic  44.09 
 
 		 157 aa  101  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 183 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0005  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.64 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  38.22 
 
 		 170 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5196  Lytic transglycosylase catalytic  41.27 
 
 		 158 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1531  Lytic transglycosylase catalytic  41.27 
 
 		 158 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  36.77 
 
 		 166 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 148 aa  94.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0037  hypothetical protein  58.75 
 
 		 116 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 		 159 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  92  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 140 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4125  lytic transglycosylase PilT  34.85 
 
 		 167 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476698 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  44 
 
 		 149 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  43 
 
 		 149 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  43 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  43 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 		 161 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  43 
 
 		 161 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 141 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_23  transglycosylase PilT  39.05 
 
 		 145 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.846222  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  43 
 
 		 148 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  36.36 
 
 		 160 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  36.36 
 
 		 160 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 175 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  37.59 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  36.36 
 
 		 160 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  36.36 
 
 		 160 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  36.36 
 
 		 160 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  39.13 
 
 		 152 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  39.13 
 
 		 161 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  39.13 
 
 		 152 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  39.13 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  39.13 
 
 		 161 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  39.13 
 
 		 152 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  37.68 
 
 		 152 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 		 148 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  39.13 
 
 		 149 aa  85.5  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  43 
 
 		 147 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  40.94 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2772  Lytic transglycosylase catalytic  38.02 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  39.17 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  35.44 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6789  lytic transglycosylase, catalytic  36.23 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  36.76 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3138  Lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.82617  normal  0.443685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.83 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  36.05 
 
 		 404 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5666  lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326026  hitchhiker  0.0069947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 407 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6234  lytic transglycosylase catalytic  39.57 
 
 		 151 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5883  lytic transglycosylase, catalytic  36.89 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.161206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  42.42 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05356  putative lipoprotein  36 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.592846  normal  0.453874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  39 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  34.33 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  32.54 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0860  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 124 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 599 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  30.88 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0632  Lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  38.24 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03391  Hpa2  44.05 
 
 		 108 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0834  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5437  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43825  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  34.06 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  34.72 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  35.88 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  35.88 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  35.88 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  35.88 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  35.88 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0011  conjugal transfer protein  27.59 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5233  lytic transglycosylase, catalytic  36.27 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00145184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  39.6 
 
 		 299 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>