More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1974 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  100 
 
 		 358 aa  734    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  68.17 
 
 		 358 aa  496  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2064  chorismate synthase  61.41 
 
 		 354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  60.85 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0114  chorismate synthase  61.48 
 
 		 366 aa  449  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1493  chorismate synthase  55.43 
 
 		 362 aa  432  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1806  chorismate synthase  58.22 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1625  chorismate synthase  58.5 
 
 		 362 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.511164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1994  chorismate synthase  57.94 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  51.46 
 
 		 365 aa  362  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  50.88 
 
 		 364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  50.88 
 
 		 364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  50.88 
 
 		 364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  50.58 
 
 		 364 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  50.58 
 
 		 364 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  50.29 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  50.14 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  49.71 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  50.29 
 
 		 376 aa  349  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  49 
 
 		 361 aa  348  9e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  49.13 
 
 		 384 aa  347  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  51.9 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  49.72 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  49.12 
 
 		 367 aa  346  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  50.72 
 
 		 364 aa  346  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  49.42 
 
 		 361 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  49.71 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  51.6 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  51.31 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  50 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  50.88 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  48.25 
 
 		 363 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  49.71 
 
 		 364 aa  343  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  48.25 
 
 		 363 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  49.85 
 
 		 365 aa  342  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  49.57 
 
 		 364 aa  342  8e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1469  chorismate synthase  51.46 
 
 		 364 aa  342  8e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  48.15 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1416  chorismate synthase  51.46 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  51.46 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  48.86 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  49.28 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1658  chorismate synthase  49.12 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2046  chorismate synthase  49.12 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1425  chorismate synthase  49.27 
 
 		 368 aa  339  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  47.8 
 
 		 361 aa  338  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  48.84 
 
 		 358 aa  338  9e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  49.71 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  49.71 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  50.58 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  48.69 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  49.71 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  49.3 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  48.57 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  49.71 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  48.31 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  49.27 
 
 		 389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  49.56 
 
 		 385 aa  336  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  50.44 
 
 		 369 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  50.44 
 
 		 369 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  50.44 
 
 		 369 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  52.34 
 
 		 352 aa  335  5.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  49.13 
 
 		 362 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  49.42 
 
 		 393 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  50.44 
 
 		 369 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  46.11 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  49.71 
 
 		 366 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  52.05 
 
 		 352 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  49.86 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  49.71 
 
 		 366 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  50.87 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  47.98 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  49.12 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  49.12 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  50.15 
 
 		 334 aa  332  4e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  48.54 
 
 		 366 aa  332  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  50.29 
 
 		 353 aa  332  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  48.84 
 
 		 367 aa  332  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  48.15 
 
 		 366 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  50.58 
 
 		 361 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  48.54 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  52.05 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  48.48 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2580  chorismate synthase  48.4 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  51.46 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  48.26 
 
 		 367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  50.88 
 
 		 361 aa  329  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  50.88 
 
 		 361 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  50.88 
 
 		 361 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  48.89 
 
 		 361 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  46.94 
 
 		 366 aa  328  7e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  51.01 
 
 		 364 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  48.98 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>