More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0619 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0619  acriflavin resistance AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 529 aa  1072    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0877  AcrB/AcrD/AcrF family protein  59.85 
 
 		 528 aa  631  1e-180  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0448595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0455  acriflavin resistance protein  42.14 
 
 		 1105 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1164  acriflavin resistance protein  39.13 
 
 		 1110 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149808  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4181  acriflavin resistance protein  38.74 
 
 		 1093 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.644693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5560  acriflavin resistance protein  38.74 
 
 		 1093 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1747  acriflavin resistance protein  39.85 
 
 		 1081 aa  359  8e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5382  acriflavin resistance protein  36.5 
 
 		 1095 aa  351  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651805  normal  0.619486 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1999  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 		 1092 aa  349  8e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.646318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2366  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  37.57 
 
 		 1092 aa  349  8e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0322  acriflavin resistance protein  37.9 
 
 		 1102 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2073  acriflavin resistance protein  37.59 
 
 		 1102 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0420991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4228  acriflavin resistance protein  37.31 
 
 		 1071 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0330177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3465  acriflavin resistance protein  37.28 
 
 		 1074 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0394  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.31 
 
 		 1077 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3127  acriflavin resistance protein  36.5 
 
 		 1071 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0790763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3380  acriflavin resistance protein  36.47 
 
 		 1092 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.412732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4086  acriflavin resistance protein  37.77 
 
 		 1117 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4053  acriflavin resistance protein  37.77 
 
 		 1118 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.69753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3851  acriflavin resistance protein  36.36 
 
 		 1077 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.35925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3249  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 		 1297 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139234  hitchhiker  0.00118635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3943  acriflavin resistance protein  37.38 
 
 		 1118 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0123  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.82 
 
 		 1074 aa  324  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.71937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2047  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1112 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3935  acriflavin resistance protein  35.01 
 
 		 1077 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1692  acriflavin resistance protein  36.43 
 
 		 1118 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0280  acriflavin resistance protein  36.06 
 
 		 1070 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.186381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1388  acriflavin resistance protein  35.81 
 
 		 1078 aa  320  6e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00288524  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2348  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1076 aa  317  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.176127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1817  acriflavin resistance protein  34.29 
 
 		 1084 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00322061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0181  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1068 aa  316  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0244  acriflavin resistance protein  35.48 
 
 		 1069 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.205434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0243  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 		 1090 aa  313  5.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2286  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1089 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.639212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2152  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.61 
 
 		 1076 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.233528  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2382  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 		 1061 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.512595 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2722  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1070 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1129  acriflavin resistance protein  34.03 
 
 		 1085 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2182  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.29 
 
 		 1073 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139177  normal  0.0189713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1742  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 		 1261 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.638591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3873  acriflavin resistance protein  34.64 
 
 		 1101 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2397  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1065 aa  302  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0981  acriflavin resistance protein  35.32 
 
 		 1090 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3343  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 		 1068 aa  300  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3725  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1072 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1103  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1072 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.779489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1454  acriflavin resistance protein  33.84 
 
 		 1131 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2473  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1066 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2113  acriflavin resistance protein  35.11 
 
 		 1063 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.568687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0663  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1065 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0460  AcrB/AcrD/AcrF family cation/multidrug efflux pump  34.92 
 
 		 1063 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1999  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.28 
 
 		 1069 aa  293  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1614  acriflavin resistance protein  34.22 
 
 		 1099 aa  293  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0729352  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0506  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1102 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.97787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0582  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.84 
 
 		 1067 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0205  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1089 aa  290  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0548  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.39 
 
 		 1099 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0305  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1076 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3302  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1096 aa  287  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2689  acriflavin resistance protein  33.02 
 
 		 1086 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3103  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.9 
 
 		 1087 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1394  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1089 aa  286  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2474  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1075 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000679191  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3057  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1084 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2775  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1080 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0117683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2611  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1094 aa  282  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0333004  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2870  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1080 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.222771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4696  acriflavin resistance protein  33.98 
 
 		 1063 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46697  normal  0.0748582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1393  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1082 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000988639  unclonable  0.0000000000715255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3744  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1100 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1446  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1076 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0138545  hitchhiker  0.0000000120634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3719  AcrB/AcrD/AcrF family cation mulitdrug efflux protein  31.29 
 
 		 1074 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1583  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1082 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0291903  hitchhiker  0.00000000741416 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2795  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1080 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000776318  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1458  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1082 aa  279  8e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00370682  unclonable  0.0000576194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1235  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.97 
 
 		 1146 aa  279  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1412  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1086 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00540284  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000104  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 		 1102 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2828  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1079 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285116  hitchhiker  0.00268553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1213  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1074 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4300  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1076 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.371235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0058  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.07 
 
 		 1067 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2440  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1084 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0608966  hitchhiker  0.0000826173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3221  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1068 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.889308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4199  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1075 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3760  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1109 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.663403  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1290 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.37 
 
 		 1191 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1058 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  25.25 
 
 		 1165 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1038 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1028 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1041 aa  166  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1062 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1057 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1029 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1043 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  27.71 
 
 		 1134 aa  163  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.08 
 
 		 1049 aa  162  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1027 aa  162  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>