More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0506 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2182  AcrB/AcrD/AcrF family protein  57.51 
 
 		 1073 aa  1124    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139177  normal  0.0189713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0394  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.38 
 
 		 1077 aa  952    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2611  acriflavin resistance protein  53.88 
 
 		 1094 aa  1100    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0333004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0244  acriflavin resistance protein  43.18 
 
 		 1069 aa  879    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.205434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1999  acriflavin resistance protein  38.01 
 
 		 1092 aa  741    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.646318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2152  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.35 
 
 		 1076 aa  789    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.233528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1583  acriflavin resistance protein  55.76 
 
 		 1082 aa  1119    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0291903  hitchhiker  0.00000000741416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3935  acriflavin resistance protein  44.43 
 
 		 1077 aa  910    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0205  acriflavin resistance protein  38.25 
 
 		 1089 aa  743    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1235  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.92 
 
 		 1146 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2870  acriflavin resistance protein  56.31 
 
 		 1080 aa  1127    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.222771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3103  AcrB/AcrD/AcrF family protein  56.51 
 
 		 1087 aa  1127    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1103  acriflavin resistance protein  42.92 
 
 		 1072 aa  763    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.779489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1394  acriflavin resistance protein  41.3 
 
 		 1089 aa  739    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3343  acriflavin resistance protein  58.42 
 
 		 1068 aa  1226    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4228  acriflavin resistance protein  46.11 
 
 		 1071 aa  946    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0330177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2397  acriflavin resistance protein  62.49 
 
 		 1065 aa  1279    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3719  AcrB/AcrD/AcrF family cation mulitdrug efflux protein  41.8 
 
 		 1074 aa  735    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2474  acriflavin resistance protein  56.35 
 
 		 1075 aa  1133    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000679191  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0460  AcrB/AcrD/AcrF family cation/multidrug efflux pump  43.24 
 
 		 1063 aa  785    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1614  acriflavin resistance protein  54.49 
 
 		 1099 aa  1096    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0729352  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4086  acriflavin resistance protein  43.51 
 
 		 1117 aa  804    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1999  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.93 
 
 		 1069 aa  857    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0123  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.91 
 
 		 1074 aa  897    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.71937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3302  acriflavin resistance protein  59.06 
 
 		 1096 aa  1187    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3057  acriflavin resistance protein  40.75 
 
 		 1084 aa  748    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3127  acriflavin resistance protein  45.61 
 
 		 1071 aa  936    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0790763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0548  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.02 
 
 		 1099 aa  723    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0455  acriflavin resistance protein  36.31 
 
 		 1105 aa  714    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2366  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  38.01 
 
 		 1092 aa  741    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1164  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1110 aa  701    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149808  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0058  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  56.83 
 
 		 1067 aa  1127    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5382  acriflavin resistance protein  37.06 
 
 		 1095 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651805  normal  0.619486 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2348  acriflavin resistance protein  44.98 
 
 		 1076 aa  914    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.176127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3873  acriflavin resistance protein  43.47 
 
 		 1101 aa  811    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3943  acriflavin resistance protein  43.05 
 
 		 1118 aa  800    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2473  acriflavin resistance protein  41.54 
 
 		 1066 aa  782    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4300  acriflavin resistance protein  42.98 
 
 		 1076 aa  737    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.371235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3760  acriflavin resistance protein  54.93 
 
 		 1109 aa  1064    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.663403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2047  acriflavin resistance protein  44.84 
 
 		 1112 aa  939    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3221  acriflavin resistance protein  42.69 
 
 		 1068 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.889308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3465  acriflavin resistance protein  45.42 
 
 		 1074 aa  926    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100065  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2440  acriflavin resistance protein  54.45 
 
 		 1084 aa  1088    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0608966  hitchhiker  0.0000826173 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5560  acriflavin resistance protein  38.28 
 
 		 1093 aa  682    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1412  acriflavin resistance protein  51.36 
 
 		 1086 aa  1023    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00540284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2795  acriflavin resistance protein  56.12 
 
 		 1080 aa  1120    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000776318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4199  acriflavin resistance protein  42.18 
 
 		 1075 aa  737    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3851  acriflavin resistance protein  44.62 
 
 		 1077 aa  900    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.35925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2828  acriflavin resistance protein  58.16 
 
 		 1079 aa  1147    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285116  hitchhiker  0.00268553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1454  acriflavin resistance protein  44.2 
 
 		 1131 aa  830    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1692  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1118 aa  794    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1747  acriflavin resistance protein  43.34 
 
 		 1081 aa  863    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2382  acriflavin resistance protein  42.95 
 
 		 1061 aa  782    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.512595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2286  acriflavin resistance protein  43.16 
 
 		 1089 aa  771    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.639212  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1213  acriflavin resistance protein  43.07 
 
 		 1074 aa  745    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0506  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1102 aa  2219    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.97787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0582  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  58.24 
 
 		 1067 aa  1182    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2722  acriflavin resistance protein  45.55 
 
 		 1070 aa  925    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180186  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4181  acriflavin resistance protein  38.35 
 
 		 1093 aa  687    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.644693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1393  acriflavin resistance protein  56.44 
 
 		 1082 aa  1128    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000988639  unclonable  0.0000000000715255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3744  acriflavin resistance protein  56.34 
 
 		 1100 aa  1090    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000104  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1102 aa  656    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1458  acriflavin resistance protein  56.62 
 
 		 1082 aa  1133    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00370682  unclonable  0.0000576194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0305  acriflavin resistance protein  55.81 
 
 		 1076 aa  1128    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1742  acriflavin resistance protein  43.77 
 
 		 1261 aa  823    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.638591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2689  acriflavin resistance protein  52.9 
 
 		 1086 aa  1106    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103254  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0243  acriflavin resistance protein  43.56 
 
 		 1090 aa  792    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2775  acriflavin resistance protein  56.22 
 
 		 1080 aa  1126    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0117683  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0280  acriflavin resistance protein  43.68 
 
 		 1070 aa  877    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.186381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1388  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1078 aa  830    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00288524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3380  acriflavin resistance protein  39.8 
 
 		 1092 aa  761    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.412732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0981  acriflavin resistance protein  56.8 
 
 		 1090 aa  1191    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1817  acriflavin resistance protein  58.4 
 
 		 1084 aa  1226    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00322061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3249  acriflavin resistance protein  40.37 
 
 		 1297 aa  811    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139234  hitchhiker  0.00118635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1446  acriflavin resistance protein  56.46 
 
 		 1076 aa  1129    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0138545  hitchhiker  0.0000000120634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0663  acriflavin resistance protein  55.14 
 
 		 1065 aa  1136    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0181  acriflavin resistance protein  44.58 
 
 		 1068 aa  938    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1129  acriflavin resistance protein  76.17 
 
 		 1085 aa  1609    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4053  acriflavin resistance protein  43.6 
 
 		 1118 aa  803    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.69753  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4696  acriflavin resistance protein  42.08 
 
 		 1063 aa  740    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46697  normal  0.0748582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2113  acriflavin resistance protein  43.05 
 
 		 1063 aa  784    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.568687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3725  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 		 1072 aa  752    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0322  acriflavin resistance protein  35.66 
 
 		 1102 aa  631  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2073  acriflavin resistance protein  35.84 
 
 		 1102 aa  622  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0420991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.74 
 
 		 1050 aa  317  8e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1043 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25.53 
 
 		 1068 aa  313  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1041 aa  311  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1063 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 		 1092 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.75 
 
 		 1191 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1028 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.09 
 
 		 1024 aa  305  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1055 aa  304  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.77 
 
 		 1034 aa  304  7.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  25.07 
 
 		 1134 aa  302  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1032 aa  301  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1051 aa  301  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  23.97 
 
 		 1058 aa  301  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1022 aa  300  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>