More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0548 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0394  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.21 
 
 
1077 aa  852    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2152  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.37 
 
 
1076 aa  1018    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.233528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2870  acriflavin resistance protein  37.01 
 
 
1080 aa  663    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.222771  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1692  acriflavin resistance protein  38.13 
 
 
1118 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4181  acriflavin resistance protein  37.5 
 
 
1093 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.644693  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1235  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.95 
 
 
1146 aa  907    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3719  AcrB/AcrD/AcrF family cation mulitdrug efflux protein  37.97 
 
 
1074 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2047  acriflavin resistance protein  39.84 
 
 
1112 aa  784    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1388  acriflavin resistance protein  39.05 
 
 
1078 aa  749    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00288524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3103  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.07 
 
 
1087 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2775  acriflavin resistance protein  36.91 
 
 
1080 aa  663    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0117683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2828  acriflavin resistance protein  39.89 
 
 
1079 aa  693    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285116  hitchhiker  0.00268553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3343  acriflavin resistance protein  39.82 
 
 
1068 aa  741    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0450597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1454  acriflavin resistance protein  40.56 
 
 
1131 aa  717    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3302  acriflavin resistance protein  39.37 
 
 
1096 aa  695    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2397  acriflavin resistance protein  40.25 
 
 
1065 aa  733    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2473  acriflavin resistance protein  36.84 
 
 
1066 aa  666    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000104  acriflavin resistance protein  46.79 
 
 
1102 aa  956    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0460  AcrB/AcrD/AcrF family cation/multidrug efflux pump  37.66 
 
 
1063 aa  676    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1999  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.81 
 
 
1069 aa  788    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0123  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.66 
 
 
1074 aa  788    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.71937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3935  acriflavin resistance protein  41.08 
 
 
1077 aa  807    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3127  acriflavin resistance protein  42.27 
 
 
1071 aa  841    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0790763  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0548  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 
1099 aa  2211    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0455  acriflavin resistance protein  36.34 
 
 
1105 aa  674    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2611  acriflavin resistance protein  36.14 
 
 
1094 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0333004  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1747  acriflavin resistance protein  39.48 
 
 
1081 aa  728    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0058  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  39.8 
 
 
1067 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2722  acriflavin resistance protein  40.42 
 
 
1070 aa  796    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3744  acriflavin resistance protein  39.78 
 
 
1100 aa  695    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3873  acriflavin resistance protein  39.37 
 
 
1101 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3943  acriflavin resistance protein  39.47 
 
 
1118 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3760  acriflavin resistance protein  37.9 
 
 
1109 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.663403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4053  acriflavin resistance protein  39.11 
 
 
1118 aa  674    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.69753  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0506  acriflavin resistance protein  38.99 
 
 
1102 aa  703    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.97787  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3221  acriflavin resistance protein  38.22 
 
 
1068 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.889308  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3725  acriflavin resistance protein  37.45 
 
 
1072 aa  662    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1583  acriflavin resistance protein  36.52 
 
 
1082 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0291903  hitchhiker  0.00000000741416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1742  acriflavin resistance protein  38.04 
 
 
1261 aa  705    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.638591  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5382  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 
1095 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651805  normal  0.619486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4199  acriflavin resistance protein  37.28 
 
 
1075 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0280  acriflavin resistance protein  41.61 
 
 
1070 aa  799    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.186381  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1129  acriflavin resistance protein  39.74 
 
 
1085 aa  727    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287542  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3465  acriflavin resistance protein  39.26 
 
 
1074 aa  782    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1103  acriflavin resistance protein  37.93 
 
 
1072 aa  670    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.779489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2286  acriflavin resistance protein  37.9 
 
 
1089 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.639212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0205  acriflavin resistance protein  59.56 
 
 
1089 aa  1272    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0244  acriflavin resistance protein  40.68 
 
 
1069 aa  786    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.205434  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4228  acriflavin resistance protein  41.16 
 
 
1071 aa  832    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0330177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1393  acriflavin resistance protein  36.84 
 
 
1082 aa  656    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000988639  unclonable  0.0000000000715255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0322  acriflavin resistance protein  37.89 
 
 
1102 aa  647    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1458  acriflavin resistance protein  36.84 
 
 
1082 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00370682  unclonable  0.0000576194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3851  acriflavin resistance protein  40.4 
 
 
1077 aa  783    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.35925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2382  acriflavin resistance protein  37.44 
 
 
1061 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.512595 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2348  acriflavin resistance protein  40.7 
 
 
1076 aa  793    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.176127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2689  acriflavin resistance protein  36.13 
 
 
1086 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103254  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2795  acriflavin resistance protein  37.01 
 
 
1080 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000776318  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0243  acriflavin resistance protein  38.13 
 
 
1090 aa  683    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1213  acriflavin resistance protein  37.45 
 
 
1074 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845004  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2474  acriflavin resistance protein  36.29 
 
 
1075 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000679191  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0582  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.78 
 
 
1067 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3380  acriflavin resistance protein  48.73 
 
 
1092 aa  1003    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.412732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4086  acriflavin resistance protein  39.02 
 
 
1117 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0981  acriflavin resistance protein  38.92 
 
 
1090 aa  720    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.546511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1817  acriflavin resistance protein  38.97 
 
 
1084 aa  717    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00322061  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3249  acriflavin resistance protein  38.26 
 
 
1297 aa  737    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139234  hitchhiker  0.00118635 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1394  acriflavin resistance protein  36.25 
 
 
1089 aa  639    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760431  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1446  acriflavin resistance protein  37.5 
 
 
1076 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0138545  hitchhiker  0.0000000120634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0181  acriflavin resistance protein  40.02 
 
 
1068 aa  796    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2073  acriflavin resistance protein  38.41 
 
 
1102 aa  650    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0420991  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4696  acriflavin resistance protein  37.58 
 
 
1063 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46697  normal  0.0748582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1614  acriflavin resistance protein  36.88 
 
 
1099 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0729352  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2182  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.42 
 
 
1073 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139177  normal  0.0189713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0663  acriflavin resistance protein  35.74 
 
 
1065 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2113  acriflavin resistance protein  37.84 
 
 
1063 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.568687  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0305  acriflavin resistance protein  39.53 
 
 
1076 aa  719    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4300  acriflavin resistance protein  36.6 
 
 
1076 aa  635  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.371235 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5560  acriflavin resistance protein  37.23 
 
 
1093 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2366  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  35.29 
 
 
1092 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2440  acriflavin resistance protein  36.52 
 
 
1084 aa  630  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0608966  hitchhiker  0.0000826173 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1999  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 
1092 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.646318  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3057  acriflavin resistance protein  37.41 
 
 
1084 aa  628  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1412  acriflavin resistance protein  35.05 
 
 
1086 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00540284  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1164  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 
1110 aa  615  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 
1043 aa  354  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 
1092 aa  347  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 
1191 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 
1050 aa  322  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 
1034 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 
1028 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 
1065 aa  309  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 
1038 aa  307  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 
1028 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.09 
 
 
1036 aa  305  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 
1026 aa  303  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 
1051 aa  301  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 
1014 aa  301  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 
1143 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 
1011 aa  297  9e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.04 
 
 
1068 aa  297  9e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>