More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000104 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1388  acriflavin resistance protein  36.18 
 
 		 1078 aa  655    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00288524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0394  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.7 
 
 		 1077 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000104  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1102 aa  2226    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2152  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.47 
 
 		 1076 aa  870    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.233528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1235  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.94 
 
 		 1146 aa  1079    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3103  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.42 
 
 		 1087 aa  646    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1742  acriflavin resistance protein  36.61 
 
 		 1261 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.638591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2795  acriflavin resistance protein  36.51 
 
 		 1080 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000776318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3343  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1068 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2397  acriflavin resistance protein  35.34 
 
 		 1065 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1454  acriflavin resistance protein  37.1 
 
 		 1131 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3851  acriflavin resistance protein  35.03 
 
 		 1077 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.35925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3465  acriflavin resistance protein  34.8 
 
 		 1074 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1999  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.86 
 
 		 1069 aa  701    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0123  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.17 
 
 		 1074 aa  717    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.71937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3127  acriflavin resistance protein  35.21 
 
 		 1071 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0790763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0548  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.93 
 
 		 1099 aa  942    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3935  acriflavin resistance protein  35.27 
 
 		 1077 aa  691    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2348  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1076 aa  702    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.176127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4228  acriflavin resistance protein  35.44 
 
 		 1071 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0330177  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2722  acriflavin resistance protein  36.78 
 
 		 1070 aa  714    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1614  acriflavin resistance protein  36.16 
 
 		 1099 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0729352  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2047  acriflavin resistance protein  36.54 
 
 		 1112 aa  716    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2474  acriflavin resistance protein  36.64 
 
 		 1075 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000679191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1583  acriflavin resistance protein  36.44 
 
 		 1082 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0291903  hitchhiker  0.00000000741416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0280  acriflavin resistance protein  36.87 
 
 		 1070 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.186381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1393  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 1082 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000988639  unclonable  0.0000000000715255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2870  acriflavin resistance protein  36.51 
 
 		 1080 aa  648    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.222771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1458  acriflavin resistance protein  36.56 
 
 		 1082 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00370682  unclonable  0.0000576194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2689  acriflavin resistance protein  35.2 
 
 		 1086 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103254  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0582  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  37.34 
 
 		 1067 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3380  acriflavin resistance protein  42.11 
 
 		 1092 aa  875    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.412732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0981  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 		 1090 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3249  acriflavin resistance protein  37.17 
 
 		 1297 aa  673    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139234  hitchhiker  0.00118635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2775  acriflavin resistance protein  36.51 
 
 		 1080 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0117683  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1446  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 1076 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0138545  hitchhiker  0.0000000120634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0181  acriflavin resistance protein  36.07 
 
 		 1068 aa  717    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2182  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.65 
 
 		 1073 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139177  normal  0.0189713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0663  acriflavin resistance protein  35.89 
 
 		 1065 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0305  acriflavin resistance protein  36.26 
 
 		 1076 aa  661    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0205  acriflavin resistance protein  45.73 
 
 		 1089 aa  959    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0244  acriflavin resistance protein  36.88 
 
 		 1069 aa  687    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.205434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2611  acriflavin resistance protein  35.62 
 
 		 1094 aa  634  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0333004  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1747  acriflavin resistance protein  35.86 
 
 		 1081 aa  632  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2440  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 		 1084 aa  629  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0608966  hitchhiker  0.0000826173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0058  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.88 
 
 		 1067 aa  625  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2473  acriflavin resistance protein  34.73 
 
 		 1066 aa  623  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0506  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 		 1102 aa  625  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.97787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0455  acriflavin resistance protein  34.59 
 
 		 1105 aa  620  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1412  acriflavin resistance protein  34.38 
 
 		 1086 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00540284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2286  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 		 1089 aa  615  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.639212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3744  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1100 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1129  acriflavin resistance protein  35.17 
 
 		 1085 aa  612  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1817  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1084 aa  612  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00322061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3725  acriflavin resistance protein  34.49 
 
 		 1072 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3873  acriflavin resistance protein  36.27 
 
 		 1101 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3760  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 		 1109 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.663403  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3221  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 		 1068 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.889308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3719  AcrB/AcrD/AcrF family cation mulitdrug efflux protein  34.59 
 
 		 1074 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0243  acriflavin resistance protein  33.7 
 
 		 1090 aa  601  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1213  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 		 1074 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845004  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4181  acriflavin resistance protein  35.23 
 
 		 1093 aa  598  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.644693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1692  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 		 1118 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3057  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1084 aa  589  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3302  acriflavin resistance protein  35.78 
 
 		 1096 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5382  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 		 1095 aa  589  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651805  normal  0.619486 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5560  acriflavin resistance protein  34.94 
 
 		 1093 aa  587  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4199  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 		 1075 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2828  acriflavin resistance protein  35.42 
 
 		 1079 aa  589  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285116  hitchhiker  0.00268553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4300  acriflavin resistance protein  34.03 
 
 		 1076 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.371235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1103  acriflavin resistance protein  33.98 
 
 		 1072 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.779489 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1999  acriflavin resistance protein  33.19 
 
 		 1092 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.646318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2382  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1061 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.512595 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2366  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.19 
 
 		 1092 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4053  acriflavin resistance protein  34.41 
 
 		 1118 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.69753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4086  acriflavin resistance protein  34.41 
 
 		 1117 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0460  AcrB/AcrD/AcrF family cation/multidrug efflux pump  33.52 
 
 		 1063 aa  572  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3943  acriflavin resistance protein  34.14 
 
 		 1118 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2113  acriflavin resistance protein  33.73 
 
 		 1063 aa  572  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.568687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1394  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1089 aa  568  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760431  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4696  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1063 aa  565  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46697  normal  0.0748582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0322  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1102 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2073  acriflavin resistance protein  34.42 
 
 		 1102 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0420991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1164  acriflavin resistance protein  33.09 
 
 		 1110 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1191 aa  296  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  24.5 
 
 		 1053 aa  295  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1034 aa  292  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1014 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1050 aa  280  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1039 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1020 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.59 
 
 		 1024 aa  275  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  24.29 
 
 		 1023 aa  274  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1048 aa  274  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.21 
 
 		 1049 aa  273  1e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1092 aa  273  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1028 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25.66 
 
 		 1068 aa  269  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.12 
 
 		 1011 aa  268  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1043 aa  264  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>