More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0582 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0394  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.58 
 
 		 1077 aa  873    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2795  acriflavin resistance protein  65.13 
 
 		 1080 aa  1363    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000776318  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2152  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.47 
 
 		 1076 aa  704    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.233528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2870  acriflavin resistance protein  65.23 
 
 		 1080 aa  1372    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.222771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2473  acriflavin resistance protein  41.64 
 
 		 1066 aa  801    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3103  AcrB/AcrD/AcrF family protein  66.45 
 
 		 1087 aa  1370    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1999  acriflavin resistance protein  37.18 
 
 		 1092 aa  707    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.646318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1747  acriflavin resistance protein  43.91 
 
 		 1081 aa  832    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3343  acriflavin resistance protein  57.26 
 
 		 1068 aa  1181    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0244  acriflavin resistance protein  43 
 
 		 1069 aa  828    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.205434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2397  acriflavin resistance protein  56.71 
 
 		 1065 aa  1152    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2047  acriflavin resistance protein  43.8 
 
 		 1112 aa  891    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0460  AcrB/AcrD/AcrF family cation/multidrug efflux pump  43.19 
 
 		 1063 aa  783    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1129  acriflavin resistance protein  60.17 
 
 		 1085 aa  1185    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1394  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1089 aa  770    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760431  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1999  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.82 
 
 		 1069 aa  820    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0123  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.39 
 
 		 1074 aa  827    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.71937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0506  acriflavin resistance protein  58.06 
 
 		 1102 aa  1158    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.97787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3725  acriflavin resistance protein  42.27 
 
 		 1072 aa  790    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3127  acriflavin resistance protein  42.76 
 
 		 1071 aa  860    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0790763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0548  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.04 
 
 		 1099 aa  696    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0455  acriflavin resistance protein  36.49 
 
 		 1105 aa  700    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3935  acriflavin resistance protein  42.71 
 
 		 1077 aa  855    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3851  acriflavin resistance protein  42.99 
 
 		 1077 aa  850    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.35925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3744  acriflavin resistance protein  55.78 
 
 		 1100 aa  1097    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0058  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  55.86 
 
 		 1067 aa  1102    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4228  acriflavin resistance protein  43.22 
 
 		 1071 aa  867    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0330177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4053  acriflavin resistance protein  40.96 
 
 		 1118 aa  780    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.69753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3873  acriflavin resistance protein  43.11 
 
 		 1101 aa  812    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3943  acriflavin resistance protein  40.73 
 
 		 1118 aa  780    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1164  acriflavin resistance protein  35.08 
 
 		 1110 aa  651    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4300  acriflavin resistance protein  43.22 
 
 		 1076 aa  777    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.371235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1454  acriflavin resistance protein  43.7 
 
 		 1131 aa  825    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5382  acriflavin resistance protein  36.09 
 
 		 1095 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651805  normal  0.619486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3760  acriflavin resistance protein  54.48 
 
 		 1109 aa  1065    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.663403  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2382  acriflavin resistance protein  43.63 
 
 		 1061 aa  785    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.512595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1583  acriflavin resistance protein  64.94 
 
 		 1082 aa  1365    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0291903  hitchhiker  0.00000000741416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3221  acriflavin resistance protein  43.99 
 
 		 1068 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.889308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2611  acriflavin resistance protein  63.3 
 
 		 1094 aa  1344    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0333004  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2775  acriflavin resistance protein  65.41 
 
 		 1080 aa  1373    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0117683  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0280  acriflavin resistance protein  42.12 
 
 		 1070 aa  818    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.186381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5560  acriflavin resistance protein  37.16 
 
 		 1093 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1412  acriflavin resistance protein  57.81 
 
 		 1086 aa  1197    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00540284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3465  acriflavin resistance protein  44.11 
 
 		 1074 aa  881    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4199  acriflavin resistance protein  42.83 
 
 		 1075 aa  767    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2440  acriflavin resistance protein  64.01 
 
 		 1084 aa  1335    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0608966  hitchhiker  0.0000826173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2366  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  37.18 
 
 		 1092 aa  707    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2286  acriflavin resistance protein  43.99 
 
 		 1089 aa  799    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.639212  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1213  acriflavin resistance protein  43.38 
 
 		 1074 aa  776    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845004  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3057  acriflavin resistance protein  40.99 
 
 		 1084 aa  739    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3302  acriflavin resistance protein  58.97 
 
 		 1096 aa  1155    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3719  AcrB/AcrD/AcrF family cation mulitdrug efflux protein  42.75 
 
 		 1074 aa  769    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4086  acriflavin resistance protein  40.96 
 
 		 1117 aa  779    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2722  acriflavin resistance protein  43.33 
 
 		 1070 aa  850    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1393  acriflavin resistance protein  65.52 
 
 		 1082 aa  1369    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000988639  unclonable  0.0000000000715255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1742  acriflavin resistance protein  40.92 
 
 		 1261 aa  772    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.638591  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1458  acriflavin resistance protein  65.33 
 
 		 1082 aa  1368    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00370682  unclonable  0.0000576194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2474  acriflavin resistance protein  65.98 
 
 		 1075 aa  1383    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000679191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1103  acriflavin resistance protein  42.63 
 
 		 1072 aa  769    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.779489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2689  acriflavin resistance protein  61.06 
 
 		 1086 aa  1310    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103254  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0243  acriflavin resistance protein  42.88 
 
 		 1090 aa  798    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0582  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  100 
 
 		 1067 aa  2164    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1614  acriflavin resistance protein  62.08 
 
 		 1099 aa  1331    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0729352  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3380  acriflavin resistance protein  39.08 
 
 		 1092 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.412732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0981  acriflavin resistance protein  53.54 
 
 		 1090 aa  1150    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1817  acriflavin resistance protein  55.45 
 
 		 1084 aa  1163    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00322061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3249  acriflavin resistance protein  42.21 
 
 		 1297 aa  812    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139234  hitchhiker  0.00118635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1446  acriflavin resistance protein  65.27 
 
 		 1076 aa  1368    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0138545  hitchhiker  0.0000000120634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2113  acriflavin resistance protein  43.1 
 
 		 1063 aa  787    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.568687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1692  acriflavin resistance protein  40.77 
 
 		 1118 aa  783    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0181  acriflavin resistance protein  42.63 
 
 		 1068 aa  842    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0205  acriflavin resistance protein  37.35 
 
 		 1089 aa  699    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000104  acriflavin resistance protein  37.3 
 
 		 1102 aa  682    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4696  acriflavin resistance protein  44.74 
 
 		 1063 aa  781    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46697  normal  0.0748582 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1388  acriflavin resistance protein  41.75 
 
 		 1078 aa  797    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00288524  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2182  AcrB/AcrD/AcrF family protein  65.5 
 
 		 1073 aa  1347    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139177  normal  0.0189713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2828  acriflavin resistance protein  57 
 
 		 1079 aa  1129    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285116  hitchhiker  0.00268553 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0663  acriflavin resistance protein  65.54 
 
 		 1065 aa  1382    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0305  acriflavin resistance protein  54.01 
 
 		 1076 aa  1130    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4181  acriflavin resistance protein  36.97 
 
 		 1093 aa  674    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.644693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2348  acriflavin resistance protein  42.78 
 
 		 1076 aa  835    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.176127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0322  acriflavin resistance protein  34.99 
 
 		 1102 aa  629  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2073  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1102 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0420991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1235  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.96 
 
 		 1146 aa  608  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1034 aa  350  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1050 aa  335  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1032 aa  333  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1092 aa  333  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 1496 aa  331  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1034 aa  327  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1063 aa  326  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1036 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.63 
 
 		 1024 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1043 aa  321  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1041 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1043 aa  315  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1044 aa  313  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1470 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  24.9 
 
 		 1058 aa  312  2.9999999999999997e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.49 
 
 		 1024 aa  311  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>