More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3741 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 275 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  53.38 
 
 		 270 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  47.96 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  38.35 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  33.45 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  33.45 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  35.71 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  35.77 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  35.77 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  32.22 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.2 
 
 		 516 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32.34 
 
 		 515 aa  112  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  29.48 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  30.77 
 
 		 515 aa  99.4  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  25.66 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  37.36 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1716  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsA  34.02 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000743548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.16 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.02 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30.91 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.02 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  34.41 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30.91 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.02 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 684 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  29.35 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5475  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 704 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  36.84 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  29.52 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.85 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 		 341 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.47 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.31 
 
 		 1157 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1431  glycosyltransferase-like protein  28.45 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0716  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000599057  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  28.97 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.04 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 573 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 398 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.63 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.18 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  34.78 
 
 		 349 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 1035 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 573 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.86 
 
 		 1168 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.41 
 
 		 312 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  31.3 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 333 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>