59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1041 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 308 aa  607  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  98.38 
 
 		 308 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  98.05 
 
 		 308 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  98.05 
 
 		 308 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  92.6 
 
 		 311 aa  541  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  87.66 
 
 		 306 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  90.43 
 
 		 306 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  90.1 
 
 		 306 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  90.1 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  70.9 
 
 		 304 aa  411  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  72.14 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  70.76 
 
 		 307 aa  388  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  70.86 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  68.23 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  49.66 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  50.17 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  50.17 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  48.11 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  50.17 
 
 		 302 aa  256  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  46.53 
 
 		 301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.71 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.18 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  40.54 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  45.1 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.06 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  27.03 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  26.34 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  29.17 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  23.84 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  24.76 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  24.52 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  24.52 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  28.98 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.82 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  24.65 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  22.95 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  21.82 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.83 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  29.17 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  24.55 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  24 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  29.59 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  24.57 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  29.94 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.61 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  27.69 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.35 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.3 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  26.39 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  26.21 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  29.77 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.36 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  26.29 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 		 288 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  26.82 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>