More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1255 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  35.97 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  36.08 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  39.23 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  31.58 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  32.21 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  32.21 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  32.71 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  33.04 
 
 		 234 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  31.2 
 
 		 245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  31.2 
 
 		 245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  31.2 
 
 		 245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  31.2 
 
 		 245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  31.4 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  31.4 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  31.4 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  32.69 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  31.4 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  31.4 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  31.4 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  31.4 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  31.4 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  31.4 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  31.79 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  31.79 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  31.79 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  28.76 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  28.93 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  28.28 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 		 248 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  26.98 
 
 		 246 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  27.78 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  28.05 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  30.81 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  23.33 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  24.28 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  29.76 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  34.68 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  27.42 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  25.53 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  25.53 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  27.12 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  27.12 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  26.55 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  28.17 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  33.63 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  26.62 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  24.62 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  25.62 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2215  phage protein  23.37 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  28.79 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  24.23 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  27.74 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1274  hypothetical protein  25.9 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2615  DNA replication protein-like protein  23.5 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00158711  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0809  AAA ATPase  26.58 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000694284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  30.25 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1792  putative transposase-related ATP-binding protein  27.62 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0585373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  28 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  28.32 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  23.76 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  23.76 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  29.75 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3402  IS21 family transposase  28.47 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0684  IS21 family transposase  28.47 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  27.33 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1638  IS21 family transposase  28.47 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  29.75 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  29.75 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3045  IS21 family transposase  28.47 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  26.71 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  26.71 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  27.87 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3288  IstB ATP binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  28.1 
 
 		 426 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  26.71 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  27.42 
 
 		 245 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  26.73 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  30.33 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  30.33 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  30.33 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  30.33 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  26.47 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  28.37 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  26.17 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  26.17 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  28.91 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  26.17 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0607  IstB domain protein ATP-binding protein  26.8 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  24.39 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1360  IstB ATP binding domain-containing protein  27.22 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>