More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2275 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  88.38 
 
 		 248 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  87.55 
 
 		 248 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  87.14 
 
 		 248 aa  441  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  79.27 
 
 		 248 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  56.2 
 
 		 249 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  56.2 
 
 		 249 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  56.2 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  49.17 
 
 		 245 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  49.17 
 
 		 245 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  49.17 
 
 		 245 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  49.17 
 
 		 245 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  49.17 
 
 		 245 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  48.76 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  48.76 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  48.76 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  48.76 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  48.76 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  48.76 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  48.76 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  48.76 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  48.76 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  46.28 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  39.01 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  32.81 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  31.77 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  31.77 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  26.98 
 
 		 276 aa  98.6  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  32.04 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  27.36 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  28.95 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  28.95 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  26.02 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  29.79 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  29.79 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  29.79 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  29.79 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  29.79 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  28.98 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2071  IstB-like ATP-binding protein  30.99 
 
 		 162 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.941019  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  25.87 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  26 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  28.67 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  26.62 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  25.37 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  25.37 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  29.37 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  27.56 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  27.64 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  29.05 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  29.05 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  29.05 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  29.05 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  29.05 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  29.05 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  29.05 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  25.41 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1413  DNA replication protein  29.22 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  25.41 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  30.52 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  28.12 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  26.13 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  26.13 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  26.13 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  26.13 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  30.52 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  26.13 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  26.13 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  26.13 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  25.34 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1798  AAA-superfamily ATPase  29.22 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  26.09 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03380  DNA replication protein  30.5 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.669388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  28.87 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  41.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  27.21 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0996  DNA replication protein  28.57 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.257554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  30 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  30 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  30 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  30 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  30 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  30 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  30 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>