More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1404 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
267 aa  557  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  46.49 
 
 
241 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  41.96 
 
 
266 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  42.98 
 
 
263 aa  175  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  39.37 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  41.67 
 
 
280 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  36.03 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  32.17 
 
 
469 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  36.06 
 
 
267 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  36.06 
 
 
267 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  36.06 
 
 
267 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  36.06 
 
 
267 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  36.06 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  32.41 
 
 
275 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  31.9 
 
 
470 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  31.96 
 
 
426 aa  102  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  33.5 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  29.67 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  34.54 
 
 
270 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  34.15 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  28.63 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  30.47 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  34.1 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  26.32 
 
 
331 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  29.17 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  26.5 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  26.2 
 
 
331 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  27.23 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  30.98 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  30.54 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  32.56 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  32.45 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  31.84 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  32.08 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  30.51 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  30.51 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  25.26 
 
 
280 aa  72  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  24.18 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  36.67 
 
 
188 aa  71.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  24.18 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  24.18 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  24.18 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  24.18 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  31.1 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  34.21 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  30.5 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  30.5 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0461295 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  25.44 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  25.44 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  25.44 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  25.44 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  34.17 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  30.5 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  25.44 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  25.44 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  25.44 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  32.14 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  25.44 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  32.39 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  32.39 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  32.39 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  31.1 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  26.04 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  25.44 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  25.73 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  25.73 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  23.5 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1792  putative transposase-related ATP-binding protein  33.11 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0585373  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  28.46 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0552  DNA replication protein DnaC  27.64 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000116033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4005  hypothetical protein  31.93 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  28.98 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  33.85 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  26.8 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  34.78 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  33.33 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  27.84 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  35.78 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  29.61 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  27.7 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  32.74 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  36.3 
 
 
230 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  21.78 
 
 
334 aa  62.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5625  transposase  32.86 
 
 
274 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426495 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl579  chromosomal replication initiator protein  26.49 
 
 
311 aa  62  0.000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  32.46 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  32.46 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  27.87 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  27.32 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  28.83 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  28.83 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  28.83 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  28.83 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.81 
 
 
458 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  27.51 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  30.86 
 
 
440 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  23.31 
 
 
345 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  27.32 
 
 
315 aa  59.7  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  32.12 
 
 
440 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>