More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0604 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  63.95 
 
 
272 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  63.95 
 
 
272 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  63.95 
 
 
272 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1787  putative transposase-associated ATP- binding protein  64.34 
 
 
280 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5625  transposase  67.48 
 
 
274 aa  352  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426495 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5070  IstB ATP binding domain-containing protein  64.66 
 
 
287 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5415  transposase  70.73 
 
 
269 aa  348  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3510  IstB ATP binding domain-containing protein  68.83 
 
 
291 aa  345  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3222  IstB ATP binding domain-containing protein  68.27 
 
 
291 aa  345  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3166  IstB ATP binding domain-containing protein  68.27 
 
 
291 aa  345  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.731238  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3299  IstB ATP binding domain-containing protein  68.42 
 
 
291 aa  342  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2702  IstB domain protein ATP-binding protein  65.81 
 
 
267 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0942  transposase  69.7 
 
 
270 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0891094  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3496  transposase  69.7 
 
 
270 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.316856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1831  transposase  69.7 
 
 
270 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0314  transposase  69.7 
 
 
270 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2443  putative transposase-associated ATP- binding protein  58.78 
 
 
283 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165117  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2558  putative transposase-associated ATP- binding protein  58.78 
 
 
283 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371505  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2707  putative transposase ATP-binding protein, IstB  58.78 
 
 
283 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3172  putative transposase-associated ATP- binding protein, IstB  58.78 
 
 
283 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290467  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3750  putative transposase-associated ATP- binding protein  58.78 
 
 
283 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.885023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0126  putative transposase-associated ATP- binding protein  58.78 
 
 
283 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6189  IstB ATP binding domain-containing protein  58.4 
 
 
283 aa  322  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5717  IstB ATP binding domain-containing protein  58.4 
 
 
283 aa  322  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451064  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4193  hypothetical protein  62.4 
 
 
287 aa  314  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.356635 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3176  ISAfe9, transposition helper protein  60.25 
 
 
275 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2400  IstB domain protein ATP-binding protein  60.25 
 
 
275 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2027  IstB domain protein ATP-binding protein  60.25 
 
 
275 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1515  IstB domain protein ATP-binding protein  60.25 
 
 
275 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2775  IstB domain protein ATP-binding protein  60.25 
 
 
275 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0462  IstB ATP binding domain-containing protein  66.67 
 
 
192 aa  248  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373098  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2871  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4324  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3140  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4344  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3790  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3548  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3764  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3945  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3517  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0252496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3186  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2045  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2720  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2647  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2806  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2322  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2181  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2667  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2141  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2094  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4413  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4440  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.57261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0599  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0777  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0813  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1022  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1067  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1127  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1138  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1257  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1578  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1637  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1828  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.703545  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1925  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2020  IstB ATP binding domain-containing protein  48.56 
 
 
248 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3714  IstB ATP binding domain-containing protein  48.15 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4484  IstB domain protein ATP-binding protein  50.22 
 
 
248 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02457  putative transposase  49.16 
 
 
240 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5325  IstB domain protein ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443001 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5450  IstB domain protein ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.532201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3083  IstB domain protein ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0085  IstB domain protein ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0613596 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0041  IstB domain protein ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4316  IstB domain protein ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406827  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2975  IstB domain protein ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.44965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2113  IstB domain protein ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2282  IstB domain protein ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  53.74 
 
 
307 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0064  IstB ATP binding domain-containing protein  43.64 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1622  IstB ATP binding domain-containing protein  43.64 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4735  IstB ATP binding domain-containing protein  60.69 
 
 
164 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  38.49 
 
 
280 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  38.4 
 
 
256 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  40.87 
 
 
255 aa  178  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  40.87 
 
 
255 aa  178  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  40.87 
 
 
255 aa  178  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  40.59 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  40.59 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1326  IstB ATP binding domain-containing protein  48.77 
 
 
166 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  41.79 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  39.26 
 
 
258 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  39.26 
 
 
258 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1297  IstB ATP binding domain-containing protein  37.61 
 
 
246 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2217  IstB ATP binding domain-containing protein  37.61 
 
 
246 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>