More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1566 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  100 
 
 		 286 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  96.13 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  95.77 
 
 		 284 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  36.03 
 
 		 259 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  38.22 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  38.22 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  42.21 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  38.22 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  33.08 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  35.98 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  37.04 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  37.04 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  37.04 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  37.04 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  37.04 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  37.04 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  37.04 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  37.04 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  37.04 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  31.58 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  35.45 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  35.45 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  35.45 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  35.45 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  35.45 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  34.87 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  32.98 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  31.91 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  32.81 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  31.91 
 
 		 248 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  30.85 
 
 		 248 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  29.28 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  26.67 
 
 		 263 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  27.08 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  27.08 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  27.08 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  27.08 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  33.59 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  31.45 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  27.94 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4484  IstB domain protein ATP-binding protein  27.54 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  29.15 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  29.15 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  29.15 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  29.15 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  30.77 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0607  IstB domain protein ATP-binding protein  23.96 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  30.77 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  31.25 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  30.23 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  29.82 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  30.23 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  30.5 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2615  DNA replication protein-like protein  26.44 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00158711  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  30.68 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  29.2 
 
 		 264 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  28.67 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  27.44 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  27.44 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  27.44 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  28.66 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  32.56 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  32.56 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3714  IstB ATP binding domain-containing protein  25.82 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4413  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4440  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.57261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0599  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0777  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0813  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1022  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1067  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1127  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1138  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1257  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1578  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1637  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2094  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2181  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2322  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2647  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2667  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2720  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2806  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2871  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3140  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3186  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3517  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0252496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3548  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3764  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3790  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3945  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4324  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4344  IstB ATP binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>