More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4914 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
271 aa  550  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
266 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
266 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
266 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  70.71 
 
 
262 aa  348  8e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  70.71 
 
 
262 aa  348  8e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  64.07 
 
 
286 aa  343  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  64.07 
 
 
286 aa  343  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  50.61 
 
 
258 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  50.61 
 
 
258 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  50.43 
 
 
259 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  50.43 
 
 
259 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  48.96 
 
 
259 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  48.13 
 
 
259 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  48.13 
 
 
259 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  47.72 
 
 
259 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  49.38 
 
 
259 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  44.4 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  44.4 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  44.4 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  44.4 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  44.4 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  44.4 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  44.4 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  42.25 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  47.58 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  47.58 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  46.19 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  46.19 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  46.19 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  46.19 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  46.19 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  46.19 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  46.19 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  46.19 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  46.19 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  47.14 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  41 
 
 
252 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  43.14 
 
 
280 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2292  IstB domain protein ATP-binding protein  44.14 
 
 
254 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0259  IstB domain protein ATP-binding protein  44.14 
 
 
254 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6843  IstB ATP binding domain-containing protein  45.81 
 
 
273 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2088  IstB domain protein ATP-binding protein  44.14 
 
 
254 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0131  IstB domain protein ATP-binding protein  43.69 
 
 
254 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  45.3 
 
 
262 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  45.3 
 
 
262 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  45.3 
 
 
262 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  45.3 
 
 
262 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  45.3 
 
 
262 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  45.3 
 
 
262 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6483  IstB ATP binding domain-containing protein  63.91 
 
 
172 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  44.87 
 
 
262 aa  201  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  40.68 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  40.68 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  40.68 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  40.68 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  45.45 
 
 
267 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  39.75 
 
 
252 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0021  transposase/IS protein  40.49 
 
 
264 aa  194  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1564  transposase/IS protein  40.49 
 
 
264 aa  194  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2885  transposase/IS protein  40.49 
 
 
264 aa  194  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  44.78 
 
 
266 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0786  IstB domain protein ATP-binding protein  41.49 
 
 
230 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1555  IstB domain protein ATP-binding protein  46.69 
 
 
271 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  45.81 
 
 
256 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0506  IstB domain protein ATP-binding protein  46.69 
 
 
271 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1508  IstB domain protein ATP-binding protein  46.69 
 
 
257 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.305327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  41.5 
 
 
257 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  41.5 
 
 
257 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3716  IstB ATP binding domain-containing protein  40.89 
 
 
258 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0109  IstB ATP binding domain-containing protein  40.89 
 
 
258 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1008  IstB ATP binding domain-containing protein  40.89 
 
 
258 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.126896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1320  IstB ATP binding domain-containing protein  40.89 
 
 
258 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2855  IstB ATP binding domain-containing protein  40.89 
 
 
258 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5620  IstB ATP binding domain-containing protein  42.62 
 
 
283 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124688  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  38.1 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0320  transposase/IS protein  40.16 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0341466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1117  transposase/IS protein  40.16 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1788  transposase/IS protein  40.16 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2273  transposase/IS protein  40.16 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00636107  hitchhiker  0.00023895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2538  transposase/IS protein  40.16 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000073065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2587  transposase/IS protein  40.16 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2796  transposase/IS protein  40.16 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3281  transposase/IS protein  40.16 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423903  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  46.04 
 
 
257 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  37.3 
 
 
260 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  37.3 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0328651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>