More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1025 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
280 aa  569  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  70.36 
 
 
256 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  60.66 
 
 
262 aa  317  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  60.66 
 
 
262 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  60.66 
 
 
262 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  60.66 
 
 
262 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  60.66 
 
 
262 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  60.66 
 
 
262 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  60.66 
 
 
262 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  59.66 
 
 
267 aa  288  9e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13669  transposase  56.43 
 
 
248 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0534177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0579  IstB ATP binding domain-containing protein  55.39 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  48.18 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  48.18 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  46.61 
 
 
262 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  46.61 
 
 
262 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  47.06 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  47.06 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  41.39 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  41.39 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  41.39 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  41.39 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  42.8 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  42.8 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  45.89 
 
 
266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  45.89 
 
 
266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  45.89 
 
 
266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  43.75 
 
 
264 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  43.75 
 
 
264 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  43.75 
 
 
264 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  43.75 
 
 
264 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  43.75 
 
 
264 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  43.75 
 
 
264 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  43.75 
 
 
264 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  43.21 
 
 
259 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  43.21 
 
 
259 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  43.21 
 
 
259 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  43.21 
 
 
259 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  43.28 
 
 
259 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  43.04 
 
 
259 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  43.04 
 
 
259 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  43.04 
 
 
259 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  43.36 
 
 
271 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  44.3 
 
 
259 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12958  transposase  65.96 
 
 
238 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  44.93 
 
 
252 aa  204  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  42.5 
 
 
265 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  42.42 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  42.42 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  42.42 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  42.42 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  41.49 
 
 
255 aa  198  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  41.49 
 
 
255 aa  198  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  41.49 
 
 
255 aa  198  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  42.79 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  43.24 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0018  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0056  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0193  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0291  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0832  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0864  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1096  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.338234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1658  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2322  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000340663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2388  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0695654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2741  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3014  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.141444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3225  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3432  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0345153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3607  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.525084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4014  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4270  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4626  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4729  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4768  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5370  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5576  ISPsy4, transposition helper protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0039  transposase/IS protein  40.74 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498862  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  36.25 
 
 
252 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  40.93 
 
 
268 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  39.19 
 
 
259 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>