More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5576 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0018  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0056  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0193  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0291  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0832  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0864  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1096  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.338234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1658  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2322  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000340663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2388  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0695654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2741  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3014  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.141444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3225  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3432  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0345153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3607  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.525084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4014  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4270  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4626  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4729  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4768  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5370  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5576  ISPsy4, transposition helper protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0039  transposase/IS protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  68.22 
 
 
259 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0357  transposase/IS protein  67.31 
 
 
262 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  68.22 
 
 
259 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  68.22 
 
 
259 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  68.22 
 
 
259 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  57.36 
 
 
268 aa  328  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  61.75 
 
 
259 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  61.35 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  61.35 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  61.35 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  60.56 
 
 
260 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0021  transposase/IS protein  55.64 
 
 
264 aa  308  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1564  transposase/IS protein  55.64 
 
 
264 aa  308  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2885  transposase/IS protein  55.64 
 
 
264 aa  308  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0047  transposase/IS protein  56.63 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2594  transposase/IS protein  56.63 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0285671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  58.14 
 
 
278 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0049  transposase/IS protein  60.16 
 
 
260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0320  transposase/IS protein  56.63 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0341466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1117  transposase/IS protein  56.63 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1788  transposase/IS protein  56.63 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2273  transposase/IS protein  56.63 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00636107  hitchhiker  0.00023895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2538  transposase/IS protein  56.63 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000073065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2587  transposase/IS protein  56.63 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2796  transposase/IS protein  56.63 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3281  transposase/IS protein  56.63 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423903  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  57.75 
 
 
279 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  58.4 
 
 
281 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2334  transposase/IS protein  58.4 
 
 
281 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  58.4 
 
 
281 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  58.4 
 
 
281 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  55.2 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  55.2 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1245  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
273 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0933  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
273 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1255  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
273 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000529674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0943  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
273 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0923  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
273 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1257  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
273 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00361337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1998  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
273 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1007  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
273 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  66.67 
 
 
491 aa  257  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  66.67 
 
 
491 aa  257  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  66.67 
 
 
489 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  66.67 
 
 
491 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  66.67 
 
 
491 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>