More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1846 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 		 271 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  71.94 
 
 		 262 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  71.94 
 
 		 262 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  67.95 
 
 		 286 aa  357  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  67.95 
 
 		 286 aa  357  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  52.08 
 
 		 259 aa  279  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  52.08 
 
 		 259 aa  279  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  53.33 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  53.33 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  49.61 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  49.61 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 		 259 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  49.22 
 
 		 259 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  52.24 
 
 		 259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  45.24 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  45.24 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  45.24 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  45.24 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  45.24 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  45.24 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  45.24 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  44 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  44.12 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  47.86 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  47.86 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  47.86 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  47.86 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  47.86 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  47.86 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  47.86 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  47.86 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  47.86 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  47.06 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  45.17 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  45.17 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0786  IstB domain protein ATP-binding protein  43.36 
 
 		 230 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  47.68 
 
 		 262 aa  218  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  46.69 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  47.26 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  47.26 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  47.26 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  47.26 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  47.26 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  47.26 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6843  IstB ATP binding domain-containing protein  46.47 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  45.89 
 
 		 280 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0506  IstB domain protein ATP-binding protein  50.44 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1555  IstB domain protein ATP-binding protein  50.44 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1508  IstB domain protein ATP-binding protein  50.44 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.305327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0259  IstB domain protein ATP-binding protein  44.89 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2088  IstB domain protein ATP-binding protein  44.89 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2292  IstB domain protein ATP-binding protein  44.89 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0131  IstB domain protein ATP-binding protein  44.44 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  41.37 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  41.37 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  41.37 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  41.37 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0021  transposase/IS protein  40.48 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1564  transposase/IS protein  40.48 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2885  transposase/IS protein  40.48 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6483  IstB ATP binding domain-containing protein  65.09 
 
 		 172 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  42.92 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  45.89 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  41.18 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  41.18 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5620  IstB ATP binding domain-containing protein  44.98 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0047  transposase/IS protein  40.94 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2594  transposase/IS protein  40.94 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0285671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0320  transposase/IS protein  40.94 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0341466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1117  transposase/IS protein  40.94 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1788  transposase/IS protein  40.94 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2273  transposase/IS protein  40.94 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00636107  hitchhiker  0.00023895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2538  transposase/IS protein  40.94 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000073065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2587  transposase/IS protein  40.94 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2796  transposase/IS protein  40.94 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3281  transposase/IS protein  40.94 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  45.22 
 
 		 267 aa  195  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  38.22 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>