More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18880 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  45.06 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  43.59 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  35.37 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  31.23 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  33.76 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  32.68 
 
 		 263 aa  92  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  31.61 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  36.3 
 
 		 188 aa  87  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  32.85 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  32.85 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  32.85 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  32.85 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  32.85 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  33.5 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  32.95 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  30.24 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  29.03 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0796  primosomal protein DnaI  29.46 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  37.61 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  34.11 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  23.97 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  33.33 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  33.83 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  32.4 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  25.82 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  28.87 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  25.62 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  28.3 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  25.82 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  28.83 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  28.29 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  31.5 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  25.1 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  24.9 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  31.68 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  31.3 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  31.21 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  25.78 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  34.55 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  28.08 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  24.9 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  31.45 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  29.8 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  29.8 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  24.9 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  24.9 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  29.8 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  24.9 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  29.41 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0358  primosomal protein DnaI  26.07 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  24.9 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  26.55 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  26.55 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  26.41 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  26.55 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  26.55 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  26.55 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  26.55 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  26.55 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  26.55 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  27.15 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  26.55 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  28.46 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  28.95 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  27.15 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  32.37 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  26.7 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  26.7 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  33.33 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  23.94 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  26.7 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  26.7 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  26.7 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  33.33 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  23.94 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  27.72 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2865  IstB domain protein ATP-binding protein  30.41 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0985234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  34.51 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5625  transposase  31.95 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.426495 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  22.58 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  33.33 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  29.77 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1531  IstB ATP binding domain-containing protein  32.21 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  25.74 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  33.03 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  27.56 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  29.09 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  31.06 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  29.09 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  29.09 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  29.87 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>