More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1816 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
280 aa  586  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  47.49 
 
 
263 aa  238  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  50 
 
 
263 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  46.99 
 
 
266 aa  234  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  54.55 
 
 
241 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  41.67 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  48.22 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  35.24 
 
 
469 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  39.9 
 
 
426 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  38.86 
 
 
470 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  38.21 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  32.92 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  34.36 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  31.33 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  31.33 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  31.33 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  31.33 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  31.28 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  33.17 
 
 
263 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  31.44 
 
 
261 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  32.61 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  28.99 
 
 
261 aa  92.4  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  28.19 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  33.17 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  29.1 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  28.77 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  37.1 
 
 
188 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  31.55 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  28.39 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  28.39 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  40.48 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  29.5 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  29.9 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  25.84 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  27.8 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  32.5 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  27.8 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  25.61 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  33.1 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  25.79 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  26.74 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  38.1 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  28.88 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  28.88 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  28.88 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0552  DNA replication protein DnaC  28.79 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000116033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  27.32 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  29.05 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  29.56 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  32 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  32 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  31.71 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  29.33 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1792  putative transposase-related ATP-binding protein  33.81 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0585373  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  30.71 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  33.09 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  33.09 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  33.09 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  29.33 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  33.33 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  25.88 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  30.95 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  30 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  34.55 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  27.49 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  29.51 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  24.9 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  24.46 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  25.28 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  28.87 
 
 
234 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2113  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  26.34 
 
 
694 aa  62  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3083  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406827  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4316  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256962  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0041  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2282  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2975  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.44965 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0085  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 
236 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0613596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  28.57 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  30.48 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  29.19 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  29.19 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  26.01 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>