More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2623 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  99.09 
 
 		 331 aa  661    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  100 
 
 		 331 aa  669    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  44.06 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  38.24 
 
 		 334 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  39.3 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  34.83 
 
 		 347 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  37.63 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  32.63 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  27.5 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  27.95 
 
 		 261 aa  92.8  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  25.65 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  27.97 
 
 		 241 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  27.93 
 
 		 270 aa  86.3  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  30.49 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  30.49 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  30.49 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  30.49 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  30.49 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  26.17 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  38.69 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  38.69 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  28.93 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  35.17 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  37.23 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  37.23 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  29.31 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  29.31 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  26.76 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  28.38 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  27.85 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  28.86 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  25 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  28.86 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  28.86 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  28.86 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  28.86 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  31.88 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  26.36 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  29.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  29.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  29.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  29.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  29.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  29.03 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  29.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  29.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  29.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  29.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  31.16 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  29.93 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  25.33 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  25.33 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  27.15 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  26.74 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  22.91 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  24.34 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  28.07 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  26.74 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3288  IstB ATP binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  35.77 
 
 		 426 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  29.1 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  29.1 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  29.1 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  29.53 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  31.46 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0607  IstB domain protein ATP-binding protein  24.23 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0230  IstB domain protein ATP-binding protein  32.58 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  35.29 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4005  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1531  IstB ATP binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0717  IstB domain protein ATP-binding protein  31.54 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.254049  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  24.68 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0119  IstB domain protein ATP-binding protein  31.54 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  24.68 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  34.96 
 
 		 469 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0017  IstB domain protein ATP-binding protein  31.3 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1435  IstB domain protein ATP-binding protein  31.3 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1293  IstB domain protein ATP-binding protein  31.3 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2180  IstB domain protein ATP-binding protein  31.3 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2847  IstB domain protein ATP-binding protein  31.3 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2256  IstB domain protein ATP-binding protein  31.3 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  31.3 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  29.94 
 
 		 252 aa  57  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0885  IstB domain protein ATP-binding protein  31.3 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0907  IstB domain protein ATP-binding protein  31.3 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  25.11 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  20.64 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1057  IstB ATP binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  27.78 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5070  IstB ATP binding domain-containing protein  24.39 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  26.4 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0216  IstB domain protein ATP-binding protein  27.67 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.488281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  25 
 
 		 258 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  25 
 
 		 258 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  25.28 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  25.28 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1360  IstB ATP binding domain-containing protein  29.44 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>