More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2418 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  100 
 
 		 347 aa  707    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  52.51 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  41.4 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  36.09 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  35.8 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  34.83 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  34.83 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  36.11 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  28.52 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  27.13 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  25.82 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  27.8 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  27.64 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  29.82 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  25.88 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  28.37 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  26.85 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  32.41 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  34.11 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  26.62 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  31.94 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  30.46 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  31.48 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  31.48 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  38.64 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  29.8 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  29.8 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  29.8 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  29.8 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  29.8 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  26.62 
 
 		 248 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  29.8 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  27.78 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  29.8 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  29.8 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  34.46 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  31.29 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  27.22 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  35.57 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  27.16 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  27.47 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  30.99 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  32.62 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  30.71 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  30.71 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  30.71 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  30.71 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  30.71 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  30.71 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  31.34 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  35.79 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  35.33 
 
 		 241 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  25.32 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3547  hypothetical protein  28.99 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2215  phage protein  25.42 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  23.79 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  23.79 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  22.86 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  28.31 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  24.57 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  27.56 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 245 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  27.74 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  27.74 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  28.7 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  32.88 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  28.7 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  28.7 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  28.7 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  28.7 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  28.24 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  28.24 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  28.24 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  28.24 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  26.17 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  26.27 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  22.82 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  27.27 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  25 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1216  IstB ATP binding domain-containing protein  25.64 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1297  IstB ATP binding domain-containing protein  28.76 
 
 		 246 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2217  IstB ATP binding domain-containing protein  28.76 
 
 		 246 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>