More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1434 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  100 
 
 		 248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  97.58 
 
 		 248 aa  503  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  88.38 
 
 		 246 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  83.87 
 
 		 248 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  80.24 
 
 		 248 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  52.61 
 
 		 249 aa  284  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  52.61 
 
 		 249 aa  284  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  52.61 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  48.15 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  48.15 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  48.15 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  48.15 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  48.15 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  48.15 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  48.15 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  48.15 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  48.15 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  47.33 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  47.33 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  47.33 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  47.33 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  47.33 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  44.44 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  37.91 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  37.09 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  28.28 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  31.91 
 
 		 286 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  31.38 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  31.38 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  32.57 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  28.82 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  26.07 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  26.07 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  25.6 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  26.55 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  26.55 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  26.55 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  26.55 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  25.13 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  27.12 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  28.67 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  26.62 
 
 		 347 aa  62  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  25.65 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  25.65 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  25.65 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  25.65 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  25.65 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  25.65 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  25.65 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0198  IstB domain protein ATP-binding protein  26.45 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6528  IstB domain protein ATP-binding protein  26.45 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3172  IstB domain protein ATP-binding protein  26.74 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  26.24 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  26.09 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  25.12 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  26.74 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  26.74 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1853  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  26.63 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  31.91 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  28.93 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0047  transposase/IS protein  28.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2594  transposase/IS protein  28.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0285671  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2413  transposase, degenerate  27.04 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  25.78 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0320  transposase/IS protein  28.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0341466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1117  transposase/IS protein  28.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1788  transposase/IS protein  28.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2273  transposase/IS protein  28.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00636107  hitchhiker  0.00023895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2538  transposase/IS protein  28.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000073065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2587  transposase/IS protein  28.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2796  transposase/IS protein  28.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3281  transposase/IS protein  28.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2044  IstB domain protein ATP-binding protein  27.04 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  27.65 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  26.09 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  28.57 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  28.57 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  25.47 
 
 		 469 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  28.57 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2071  IstB-like ATP-binding protein  28.87 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.941019  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0885  IstB domain protein ATP-binding protein  26.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  24.47 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  24.47 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  24.32 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  24.32 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0017  IstB domain protein ATP-binding protein  26.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1293  IstB domain protein ATP-binding protein  26.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0907  IstB domain protein ATP-binding protein  26.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2180  IstB domain protein ATP-binding protein  26.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1435  IstB domain protein ATP-binding protein  26.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2256  IstB domain protein ATP-binding protein  26.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  26.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2847  IstB domain protein ATP-binding protein  26.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03380  DNA replication protein  30.61 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.669388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>