More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2413 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2413  transposase, degenerate  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2044  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307112  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  69.55 
 
 
262 aa  327  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  69.55 
 
 
262 aa  327  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  69.55 
 
 
262 aa  327  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6528  IstB domain protein ATP-binding protein  67.58 
 
 
262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0198  IstB domain protein ATP-binding protein  67.58 
 
 
262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320688 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5654  IstB ATP binding domain-containing protein  67.74 
 
 
262 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4736  IstB ATP binding domain-containing protein  67.74 
 
 
262 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2512  IstB ATP binding domain-containing protein  67.74 
 
 
262 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.931109 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4904  IstB ATP binding domain-containing protein  64.55 
 
 
262 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1792  putative transposase-related ATP-binding protein  63.89 
 
 
262 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0585373  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  58.42 
 
 
275 aa  254  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6242  IstB ATP binding domain-containing protein  67.36 
 
 
147 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0015  IstB ATP binding domain-containing protein  67.36 
 
 
147 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541558  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2298  IstB ATP binding domain-containing protein  67.36 
 
 
147 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357234  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4772  IstB ATP binding domain-containing protein  65.03 
 
 
143 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
252 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
263 aa  148  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  40.1 
 
 
262 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  40.1 
 
 
262 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  39.39 
 
 
286 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  39.39 
 
 
286 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  39.09 
 
 
280 aa  141  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  39.02 
 
 
271 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  37.06 
 
 
259 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  37.06 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3872  IstB domain protein ATP-binding protein  35.07 
 
 
263 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  0.0551176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  37.56 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  37.06 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  37.56 
 
 
259 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  38.38 
 
 
247 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  38.58 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  38.58 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  38.58 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2467  IstB ATP binding domain-containing protein  39.59 
 
 
269 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  40.1 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  40.1 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  40.1 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  40.1 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  40.1 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  40.1 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  40.1 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  40.1 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  40.1 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3547  hypothetical protein  40.7 
 
 
249 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  37.56 
 
 
221 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  37.88 
 
 
246 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  38.89 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  38.89 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  38.89 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  38.89 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  38.89 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  38.89 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  36.59 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  38.89 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  38.61 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  38.61 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  37.61 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  38.38 
 
 
259 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  38.38 
 
 
259 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  38.38 
 
 
259 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  40.61 
 
 
267 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  38.38 
 
 
259 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  38.31 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  35.58 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  35.58 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  35.58 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  38.31 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  38.31 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  35.58 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  38.07 
 
 
285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  35.03 
 
 
252 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1508  IstB domain protein ATP-binding protein  41.62 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.305327  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1555  IstB domain protein ATP-binding protein  41.62 
 
 
271 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0506  IstB domain protein ATP-binding protein  41.62 
 
 
271 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  36.36 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  36.36 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  36.36 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  37.06 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  37.06 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  40.1 
 
 
255 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  37.06 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  36.63 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  36.32 
 
 
243 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  36.32 
 
 
243 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  37.88 
 
 
257 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  37.88 
 
 
257 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3158  IstB domain protein ATP-binding protein  37.56 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2089  IstB domain protein ATP-binding protein  37.56 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  35.86 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0943  IstB domain protein ATP-binding protein  34.15 
 
 
273 aa  128  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0923  IstB domain protein ATP-binding protein  34.15 
 
 
273 aa  128  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0933  IstB domain protein ATP-binding protein  34.15 
 
 
273 aa  128  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6843  IstB ATP binding domain-containing protein  38.07 
 
 
273 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1007  IstB domain protein ATP-binding protein  34.15 
 
 
273 aa  128  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1245  IstB domain protein ATP-binding protein  34.15 
 
 
273 aa  128  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1255  IstB domain protein ATP-binding protein  34.15 
 
 
273 aa  128  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000529674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>