More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2283 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 248 aa  517  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  80.24 
 
 		 248 aa  421  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  80.65 
 
 		 248 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  79.44 
 
 		 248 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  79.27 
 
 		 246 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  55.42 
 
 		 249 aa  292  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  55.42 
 
 		 249 aa  292  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  55.42 
 
 		 249 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  49.38 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  49.38 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  49.38 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  49.38 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  50.21 
 
 		 245 aa  258  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  50.21 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  50.21 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  50.21 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  50.21 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  50.21 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  50.21 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  50.21 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  50.21 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  49.38 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  46.09 
 
 		 245 aa  238  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  35.02 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  31.91 
 
 		 286 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  31.38 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  31.38 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  33.16 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  34.86 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  27.27 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  30.46 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  25.69 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  27.6 
 
 		 259 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  27.6 
 
 		 259 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  27.42 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  29.05 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  34.19 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  34.19 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  34.19 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  34.19 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  34.19 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  29.05 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  29.73 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  26.49 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  28.49 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  29.71 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  29.03 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2071  IstB-like ATP-binding protein  29.66 
 
 		 162 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.941019  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  26.97 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  36.96 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  31.58 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  31.58 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  29.58 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9616  IS21 family transposase  36.78 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0788142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  25.52 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  28.14 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  28.14 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  28.14 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  28.14 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2044  IstB domain protein ATP-binding protein  27.74 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2413  transposase, degenerate  27.74 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  28.39 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  29.05 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  29.05 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  29.05 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  29.05 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0357  transposase/IS protein  26 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  26.51 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  26.51 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  26.51 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  32.14 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  32.14 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  25.5 
 
 		 334 aa  58.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  26.7 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  26.7 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  25.94 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  31.16 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  31.16 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03380  DNA replication protein  30.5 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.669388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2702  IstB domain protein ATP-binding protein  26.55 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  29.29 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  30.83 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  26.7 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>