More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2702 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2702  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
267 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  69.67 
 
 
272 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  69.67 
 
 
272 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  69.67 
 
 
272 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1787  putative transposase-associated ATP- binding protein  70.08 
 
 
280 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  63.28 
 
 
277 aa  347  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  63.28 
 
 
277 aa  347  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  63.28 
 
 
277 aa  347  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  63.28 
 
 
277 aa  347  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2775  IstB domain protein ATP-binding protein  67.72 
 
 
275 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2400  IstB domain protein ATP-binding protein  67.72 
 
 
275 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1515  IstB domain protein ATP-binding protein  67.72 
 
 
275 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2027  IstB domain protein ATP-binding protein  67.72 
 
 
275 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3176  ISAfe9, transposition helper protein  67.72 
 
 
275 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5625  transposase  61.24 
 
 
274 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426495 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5070  IstB ATP binding domain-containing protein  60.55 
 
 
287 aa  318  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5415  transposase  61.54 
 
 
269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3510  IstB ATP binding domain-containing protein  60.71 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3222  IstB ATP binding domain-containing protein  59.62 
 
 
291 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3166  IstB ATP binding domain-containing protein  59.62 
 
 
291 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.731238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2443  putative transposase-associated ATP- binding protein  60.08 
 
 
283 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165117  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2558  putative transposase-associated ATP- binding protein  60.08 
 
 
283 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371505  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2707  putative transposase ATP-binding protein, IstB  60.08 
 
 
283 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3172  putative transposase-associated ATP- binding protein, IstB  60.08 
 
 
283 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290467  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3750  putative transposase-associated ATP- binding protein  60.08 
 
 
283 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.885023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0126  putative transposase-associated ATP- binding protein  60.08 
 
 
283 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6189  IstB ATP binding domain-containing protein  59.4 
 
 
283 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5717  IstB ATP binding domain-containing protein  59.4 
 
 
283 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451064  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3299  IstB ATP binding domain-containing protein  60.32 
 
 
291 aa  299  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4193  hypothetical protein  58.23 
 
 
287 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.356635 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3496  transposase  59.23 
 
 
270 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.316856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0942  transposase  59.23 
 
 
270 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0891094  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0314  transposase  59.23 
 
 
270 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1831  transposase  59.23 
 
 
270 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2871  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2720  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4324  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2806  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4344  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3186  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3140  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3548  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3517  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0252496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3790  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3764  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3945  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4413  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4440  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.57261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0599  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0777  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0813  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1022  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1067  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1127  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1138  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1257  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1578  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1637  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1828  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.703545  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1925  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2020  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2045  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2094  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2141  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2181  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2322  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2647  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2667  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3714  IstB ATP binding domain-containing protein  48.74 
 
 
248 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4484  IstB domain protein ATP-binding protein  49.1 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02457  putative transposase  45.15 
 
 
240 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0462  IstB ATP binding domain-containing protein  60.47 
 
 
192 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373098  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5450  IstB domain protein ATP-binding protein  47.16 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.532201 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5325  IstB domain protein ATP-binding protein  47.16 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2975  IstB domain protein ATP-binding protein  46.72 
 
 
236 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.44965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2113  IstB domain protein ATP-binding protein  46.72 
 
 
236 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2282  IstB domain protein ATP-binding protein  46.72 
 
 
236 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3083  IstB domain protein ATP-binding protein  46.72 
 
 
236 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4316  IstB domain protein ATP-binding protein  46.72 
 
 
236 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  46.72 
 
 
236 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406827  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0041  IstB domain protein ATP-binding protein  46.72 
 
 
236 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0085  IstB domain protein ATP-binding protein  46.72 
 
 
236 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0613596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0064  IstB ATP binding domain-containing protein  43.88 
 
 
270 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1622  IstB ATP binding domain-containing protein  43.88 
 
 
270 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4735  IstB ATP binding domain-containing protein  64.39 
 
 
164 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  37.5 
 
 
280 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  50.58 
 
 
307 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1326  IstB ATP binding domain-containing protein  47.74 
 
 
166 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  40 
 
 
255 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  40 
 
 
255 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  40 
 
 
255 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  37.08 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  37.08 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  36.13 
 
 
262 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  36.13 
 
 
262 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  36.13 
 
 
262 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  36.13 
 
 
262 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  36.13 
 
 
262 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  36.13 
 
 
262 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>