More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9616 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9616  IS21 family transposase  100 
 
 		 195 aa  396  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0788142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  86.59 
 
 		 291 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  86.59 
 
 		 291 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  86.59 
 
 		 291 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  86.59 
 
 		 291 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  86.59 
 
 		 291 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  86.59 
 
 		 291 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  86.59 
 
 		 291 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  86.59 
 
 		 291 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  86.59 
 
 		 291 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  72.63 
 
 		 285 aa  276  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  72.63 
 
 		 285 aa  276  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  71.58 
 
 		 285 aa  275  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6843  IstB ATP binding domain-containing protein  71.95 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  56.58 
 
 		 258 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  56.58 
 
 		 258 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  51.61 
 
 		 259 aa  188  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  51.61 
 
 		 259 aa  188  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  51.97 
 
 		 266 aa  174  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  51.97 
 
 		 266 aa  174  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  51.97 
 
 		 266 aa  174  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  51.97 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  51.97 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  51.97 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  51.97 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  51.97 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  51.97 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  51.97 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  52.63 
 
 		 265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  56.85 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  56.85 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  52.38 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  52.38 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  52.38 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  52.38 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  55.63 
 
 		 262 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  55.63 
 
 		 262 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2292  IstB domain protein ATP-binding protein  47.68 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  51.33 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0259  IstB domain protein ATP-binding protein  47.68 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2088  IstB domain protein ATP-binding protein  47.68 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  52.38 
 
 		 259 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0131  IstB domain protein ATP-binding protein  47.68 
 
 		 254 aa  165  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  51.97 
 
 		 262 aa  164  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  52.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  47.68 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  47.68 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  47.68 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  47.68 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  51.32 
 
 		 262 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  51.32 
 
 		 262 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  51.32 
 
 		 262 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  51.32 
 
 		 262 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  51.32 
 
 		 262 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  51.32 
 
 		 262 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3716  IstB ATP binding domain-containing protein  50.33 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0109  IstB ATP binding domain-containing protein  50.33 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1008  IstB ATP binding domain-containing protein  50.33 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.126896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1320  IstB ATP binding domain-containing protein  50.33 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2855  IstB ATP binding domain-containing protein  50.33 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1257  IstB ATP binding domain-containing protein  43.95 
 
 		 401 aa  162  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.679289  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  52.98 
 
 		 491 aa  161  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  52.98 
 
 		 491 aa  161  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  52.98 
 
 		 491 aa  161  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  52.98 
 
 		 491 aa  161  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>