More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0105 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  100 
 
 		 334 aa  684    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  40.75 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  38.24 
 
 		 331 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  37.93 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  35.05 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  35.8 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  35.58 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  37.24 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  27.33 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  26.12 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  25.4 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  27.06 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  25.98 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  27 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  31.51 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  26.02 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  28.47 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  28.47 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  28.47 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  28.47 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  29.17 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  34.03 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  27.39 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  27.39 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  23.93 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  32.37 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  30.8 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  32.37 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  32.37 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  32.37 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  23.11 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  26.24 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  25.54 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  24.89 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  24.4 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  28.33 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  28.49 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  27.71 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  20.96 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  25.16 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  26.96 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0607  IstB domain protein ATP-binding protein  24.81 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4005  hypothetical protein  25.27 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  25.45 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  31.85 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  22.58 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  26.84 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  26.84 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  26.84 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  26.84 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  26.84 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  26.84 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  26.84 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0796  primosomal protein DnaI  23.08 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0358  primosomal protein DnaI  30.61 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  25.5 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  27.56 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  28.15 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  26.84 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  28.81 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  27.34 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  25.3 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  26.84 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  22.56 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  30.57 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  23.66 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0316  IstB domain protein ATP-binding protein  30.77 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2089  IstB domain protein ATP-binding protein  30.77 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3158  IstB domain protein ATP-binding protein  30.77 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  28.67 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3288  IstB ATP binding domain-containing protein  24.68 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2467  IstB ATP binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  24.16 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0582  IstB ATP binding domain-containing protein  23.87 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2757  IstB ATP binding domain-containing protein  23.87 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  26.97 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2702  IstB domain protein ATP-binding protein  31.25 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  21.28 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  21.28 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  23.27 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  30.4 
 
 		 436 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  21.28 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0831  DNA replication protein-like protein  30.65 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  21.28 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  21.28 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  21.28 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  21.28 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  21.28 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  29.8 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  25.82 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  25.82 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  24.83 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  25.82 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  28.08 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  28.08 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1671  DNA replication protein  26.25 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  21.02 
 
 		 245 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>