124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0796 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0796  primosomal protein DnaI  100 
 
 
293 aa  607  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0358  primosomal protein DnaI  47.67 
 
 
300 aa  288  8e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  47.67 
 
 
300 aa  275  6e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  42 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  36.25 
 
 
313 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  38.61 
 
 
311 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  36.54 
 
 
312 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  38.21 
 
 
312 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  38.21 
 
 
312 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  38.21 
 
 
312 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  38.21 
 
 
312 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  37.91 
 
 
312 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  38.21 
 
 
312 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  38.21 
 
 
312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  38.21 
 
 
312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  38.21 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  34.07 
 
 
315 aa  189  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  37.21 
 
 
312 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  34.87 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  0.000000000000115155 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1741  primosomal protein DnaI  32.57 
 
 
306 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1775  primosomal protein DnaI  32.57 
 
 
306 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  30.94 
 
 
306 aa  149  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0678  replicative DNA helicase loader DnaI  31.67 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0122  primosomal protein DnaI  37.38 
 
 
337 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0444634  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  32.52 
 
 
311 aa  94  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  30.09 
 
 
241 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  36.44 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl579  chromosomal replication initiator protein  28.57 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  33.08 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  32.33 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  32.33 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  32.33 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  32.33 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  32.52 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  34.21 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  28.26 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  26.32 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  31.62 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  30.72 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  31.62 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  29.41 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  29.37 
 
 
275 aa  62.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  27.21 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  28.68 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  29.01 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  33.06 
 
 
270 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0311  hypothetical protein  27.7 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  25.5 
 
 
261 aa  59.3  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  27.52 
 
 
261 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  25.16 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  27.81 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  28.57 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  29.57 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  24.85 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  28.95 
 
 
241 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  26.09 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  27.19 
 
 
426 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  23.78 
 
 
259 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  23.78 
 
 
259 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  25.62 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.370706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  25.53 
 
 
345 aa  52.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  28.19 
 
 
260 aa  52.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  23.5 
 
 
188 aa  52.4  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  26.15 
 
 
469 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5317  DNA replication protein  25.74 
 
 
254 aa  52.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7435  IstB ATP binding domain-containing protein  24.16 
 
 
252 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277043  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7670  IstB ATP binding domain-containing protein  24.16 
 
 
252 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  26.27 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  26.32 
 
 
470 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  25.66 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  27.93 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  25.28 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  25.28 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  25.28 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0053  IstB domain protein ATP-binding protein  25.5 
 
 
246 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1545  IstB domain protein ATP-binding protein  25.5 
 
 
246 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138616  normal  0.0723168 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  27.64 
 
 
327 aa  49.3  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  27.48 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2615  DNA replication protein-like protein  28.85 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00158711  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  28.99 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  27.82 
 
 
331 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  27.82 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  28.68 
 
 
267 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  24.19 
 
 
234 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1039  IstB ATP binding domain-containing protein  24.53 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  23.03 
 
 
243 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  27.13 
 
 
245 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  27.13 
 
 
245 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  27.13 
 
 
245 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  27.13 
 
 
245 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  27.13 
 
 
245 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1549  IstB domain protein ATP-binding protein  25.16 
 
 
250 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1595  IstB domain protein ATP-binding protein  25.16 
 
 
250 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0526328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  27.13 
 
 
245 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  27.13 
 
 
245 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  27.13 
 
 
245 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  27.13 
 
 
245 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  27.13 
 
 
245 aa  45.8  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  27.13 
 
 
245 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  27.13 
 
 
245 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>