More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2757 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0582  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2757  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12190  DNA replication protein  79.76 
 
 
261 aa  420  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.748018  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4273  IstB domain protein ATP-binding protein  68.72 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4010  IstB domain protein ATP-binding protein  69.83 
 
 
276 aa  349  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0182619  hitchhiker  0.00403882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2666  IstB domain protein ATP-binding protein  47.76 
 
 
262 aa  215  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  42.79 
 
 
239 aa  181  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  35 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  34.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0021  transposase/IS protein  33.47 
 
 
264 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1564  transposase/IS protein  33.47 
 
 
264 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2885  transposase/IS protein  33.47 
 
 
264 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  32.92 
 
 
264 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  32.92 
 
 
264 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  32.92 
 
 
264 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  32.92 
 
 
264 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  32.92 
 
 
264 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  32.92 
 
 
264 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  32.92 
 
 
264 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  31.45 
 
 
252 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  31.45 
 
 
252 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  31.45 
 
 
252 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  31.45 
 
 
252 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0049  transposase/IS protein  33.76 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  30.29 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  30.29 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  30.29 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  30.29 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1413  DNA replication protein  32.52 
 
 
254 aa  119  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  28.93 
 
 
272 aa  119  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1798  AAA-superfamily ATPase  32.52 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  30.98 
 
 
265 aa  118  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1257  IstB domain protein ATP-binding protein  30.2 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00361337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0943  IstB domain protein ATP-binding protein  30.2 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1255  IstB domain protein ATP-binding protein  30.2 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000529674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0933  IstB domain protein ATP-binding protein  30.2 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1007  IstB domain protein ATP-binding protein  30.2 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0923  IstB domain protein ATP-binding protein  30.2 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1998  IstB domain protein ATP-binding protein  30.2 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1245  IstB domain protein ATP-binding protein  30.2 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0996  DNA replication protein  32.04 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.257554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  33.66 
 
 
240 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  33.66 
 
 
240 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  33.66 
 
 
240 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  33.66 
 
 
240 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  33.66 
 
 
240 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  29.88 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  29.88 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  30.43 
 
 
261 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  30.43 
 
 
261 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  34.44 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  34.44 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  32.68 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  34.44 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  34.44 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  31.2 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  32.68 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  33.19 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2334  transposase/IS protein  33.19 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  33.19 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  33.19 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  37.68 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  37.68 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1096  ISPsy4, transposition helper protein  35.15 
 
 
269 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.338234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1658  ISPsy4, transposition helper protein  35.15 
 
 
269 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5370  ISPsy4, transposition helper protein  35.15 
 
 
269 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>