More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0023 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2750  IstB-like ATP-binding protein  64.58 
 
 
241 aa  336  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.512582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2952  IstB-like ATP-binding protein  51.3 
 
 
241 aa  259  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0822  IstB-like ATP-binding protein  51.3 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00034623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1996  IstB-like ATP-binding protein  51.3 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  40.51 
 
 
250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  40.93 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3066  IstB domain protein ATP-binding protein  39.21 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0316  DNA replication protein  39.91 
 
 
253 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.759791  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0708  DNA replication protein  39.91 
 
 
253 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.362412  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1655  DNA replication protein  39.91 
 
 
253 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0026  DNA replication protein  39.91 
 
 
253 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0857725  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1801  DNA replication protein  39.91 
 
 
253 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  45.27 
 
 
252 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  45.27 
 
 
252 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  45.27 
 
 
252 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  45.27 
 
 
252 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1413  DNA replication protein  42.11 
 
 
254 aa  188  8e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1798  AAA-superfamily ATPase  42.11 
 
 
233 aa  187  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0996  DNA replication protein  41.63 
 
 
261 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.257554  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  41.95 
 
 
267 aa  181  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03380  DNA replication protein  43 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.669388  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  39.08 
 
 
248 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  39.55 
 
 
261 aa  179  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  39.55 
 
 
261 aa  179  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  40.28 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  40.28 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  40.28 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  40.49 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  40.49 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  40.49 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  40.49 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  40.49 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  40.49 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  42.86 
 
 
252 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  42.86 
 
 
252 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  42.86 
 
 
252 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  39.02 
 
 
262 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  42.33 
 
 
255 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  37.28 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0025  IstB ATP binding domain-containing protein  41.46 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1297  IstB ATP binding domain-containing protein  41.46 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2217  IstB ATP binding domain-containing protein  41.46 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  39.9 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  39.9 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  39.9 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  36.92 
 
 
221 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  38.91 
 
 
268 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3051  IstB ATP binding domain-containing protein  36 
 
 
266 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  36.07 
 
 
277 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3172  IstB domain protein ATP-binding protein  37.96 
 
 
265 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  35.58 
 
 
269 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  35.58 
 
 
269 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  37.98 
 
 
277 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  37.98 
 
 
277 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  37.98 
 
 
253 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  37.5 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  37.5 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0738  IstB ATP binding domain-containing protein  38.12 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0830  IstB ATP binding domain-containing protein  38.12 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1215  IstB ATP binding domain-containing protein  38.12 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3098  IstB ATP binding domain-containing protein  38.12 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0684  IS21 family transposase  39.61 
 
 
264 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  37.98 
 
 
268 aa  155  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>