50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1671 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1671  DNA replication protein  100 
 
 
257 aa  525  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  26.98 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2215  phage protein  25.56 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  29.66 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  29.66 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  29.66 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  25.78 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2598  phage protein  26.67 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  26.25 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  28.67 
 
 
263 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  25.67 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  27.97 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  27.97 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  27.97 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  27.97 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  26.81 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  26.6 
 
 
280 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  26.54 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  26.62 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  22.35 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  24.9 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  25.9 
 
 
469 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  25.9 
 
 
470 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  31.91 
 
 
269 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  31.91 
 
 
269 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  25.9 
 
 
426 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  28.12 
 
 
331 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  26.09 
 
 
331 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  32.98 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  32.98 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  32.98 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  29.05 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.93 
 
 
482 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000460391  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  28.97 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  24.82 
 
 
297 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  24.82 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  26.55 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  24.82 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  34.21 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  34.21 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  27.16 
 
 
188 aa  42.7  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  31.46 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2750  IstB-like ATP-binding protein  27.22 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.512582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3172  IstB domain protein ATP-binding protein  32.94 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  25.67 
 
 
319 aa  42  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.83 
 
 
481 aa  42  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000310067  unclonable  0.000054574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0001  chromosomal replication initiation protein  27.5 
 
 
487 aa  42  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.775334  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  35.29 
 
 
277 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.83 
 
 
481 aa  42  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168448  unclonable  0.00000204804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  26.67 
 
 
260 aa  42  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>