More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2340 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
241 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  65.64 
 
 
263 aa  318  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  67.26 
 
 
263 aa  317  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  60.18 
 
 
266 aa  287  9e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  52.77 
 
 
280 aa  228  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  46.49 
 
 
267 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  44.28 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  46.99 
 
 
470 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  36.11 
 
 
469 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  41.67 
 
 
236 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  35.87 
 
 
267 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  35.87 
 
 
267 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  35.87 
 
 
267 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  35.87 
 
 
267 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  36.2 
 
 
263 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  36.17 
 
 
241 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  31.25 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  48.28 
 
 
275 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  33.96 
 
 
245 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  31.54 
 
 
261 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  38.53 
 
 
270 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  31.6 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  28.63 
 
 
261 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  38.3 
 
 
283 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  33.86 
 
 
259 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  33.86 
 
 
259 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  41.18 
 
 
188 aa  88.6  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  29.41 
 
 
280 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  32.27 
 
 
275 aa  85.5  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  28.81 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  29.85 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  29.85 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  31.82 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  31.82 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  31.82 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  32.31 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  29.56 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  31.25 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  30.29 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  37.61 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  40.13 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  36.07 
 
 
327 aa  79  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  31.25 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  28.28 
 
 
348 aa  78.6  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  31.25 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  31.25 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  31.25 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  31.55 
 
 
306 aa  78.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  31.25 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  30.68 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  33.87 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  30.65 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  29.19 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  29.19 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  29.19 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  29.19 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  29.19 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  30 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  29.19 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  29.19 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  29.19 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  29.19 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  29.52 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  27.96 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  29.19 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  29.19 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  29.19 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  34.17 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  29.19 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  31.68 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  33.33 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  28.63 
 
 
276 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  28.63 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  31.54 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  34.68 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  28.3 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  27.75 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  27.75 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  28.57 
 
 
311 aa  72  0.000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  31.19 
 
 
284 aa  72  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  31.19 
 
 
284 aa  71.6  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  30.37 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  29.23 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  28.35 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  29.67 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  32.8 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  32.71 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1741  primosomal protein DnaI  27.22 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1775  primosomal protein DnaI  27.22 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  27.98 
 
 
306 aa  68.6  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  30.51 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  28.06 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0678  replicative DNA helicase loader DnaI  30.6 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  33.11 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  27.01 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2044  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307112  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  31.82 
 
 
343 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2413  transposase, degenerate  28.3 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  31.4 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>