More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2750 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2750  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 		 241 aa  497  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.512582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  64.58 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  64.58 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  64.58 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  64.58 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  64.58 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2952  IstB-like ATP-binding protein  50.86 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0822  IstB-like ATP-binding protein  51.28 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00034623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1996  IstB-like ATP-binding protein  51.28 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  43.91 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3066  IstB domain protein ATP-binding protein  42.47 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1655  DNA replication protein  38.56 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1801  DNA replication protein  38.56 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272316  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0026  DNA replication protein  38.56 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0857725  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0708  DNA replication protein  38.56 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.362412  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0316  DNA replication protein  38.56 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.759791  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1413  DNA replication protein  42.44 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0996  DNA replication protein  42.44 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.257554  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1798  AAA-superfamily ATPase  42.24 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  38.96 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  38.96 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03380  DNA replication protein  42.08 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.669388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  38.68 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  38.68 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  38.68 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  38.68 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  40 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  38.02 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  38.02 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  38.02 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  42.79 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  42.79 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  42.79 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  40.38 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  39.81 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  42.51 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0357  transposase/IS protein  35.89 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  39.42 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  39.42 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  39.42 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  39.42 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  39.42 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  39.42 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  39.08 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  39.08 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  39.08 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  39.08 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  40 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  37.2 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  37.96 
 
 		 275 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  38.84 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0049  transposase/IS protein  40.58 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  36.71 
 
 		 269 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  36.71 
 
 		 269 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  40 
 
 		 278 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  38.54 
 
 		 261 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  39.51 
 
 		 279 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  38.54 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0738  IstB ATP binding domain-containing protein  38.34 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0830  IstB ATP binding domain-containing protein  38.34 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1215  IstB ATP binding domain-containing protein  38.34 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3098  IstB ATP binding domain-containing protein  38.34 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1658  ISPsy4, transposition helper protein  36.48 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0039  transposase/IS protein  36.48 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>