More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2952 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2952  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0822  IstB-like ATP-binding protein  83.82 
 
 		 241 aa  391  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00034623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1996  IstB-like ATP-binding protein  83.82 
 
 		 241 aa  391  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  51.3 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  51.3 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  51.3 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  51.3 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  51.3 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2750  IstB-like ATP-binding protein  50.86 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.512582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  38.86 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  37.13 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1801  DNA replication protein  38.6 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272316  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0026  DNA replication protein  38.6 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0857725  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0316  DNA replication protein  38.6 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.759791  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0708  DNA replication protein  38.6 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.362412  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1655  DNA replication protein  38.6 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  39.33 
 
 		 252 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  39.33 
 
 		 252 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  39.33 
 
 		 252 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  39.33 
 
 		 252 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03380  DNA replication protein  39.66 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.669388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  40.19 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3066  IstB domain protein ATP-binding protein  36.56 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1798  AAA-superfamily ATPase  36.61 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1413  DNA replication protein  35.93 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0996  DNA replication protein  35.5 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.257554  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  33.91 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  33.91 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  32.78 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  34.02 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  38.39 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  38.39 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  38.39 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  32.51 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  33.2 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  33.2 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  33.2 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  33.2 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  33.2 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  33.2 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1998  IstB domain protein ATP-binding protein  36.89 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1255  IstB domain protein ATP-binding protein  36.89 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000529674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1257  IstB domain protein ATP-binding protein  36.89 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00361337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0923  IstB domain protein ATP-binding protein  36.89 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0933  IstB domain protein ATP-binding protein  36.89 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0943  IstB domain protein ATP-binding protein  36.89 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1245  IstB domain protein ATP-binding protein  36.89 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1007  IstB domain protein ATP-binding protein  36.89 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2071  IstB-like ATP-binding protein  50.34 
 
 		 162 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.941019  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  39.22 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  39.22 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  32.92 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  35.27 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.938722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5131  IstB ATP binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701045  normal  0.85319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0909  IstB ATP binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3052  IstB ATP binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3391  IstB ATP binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  35.27 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  35.27 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  35.27 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  34.87 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  39.42 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  36.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>