More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0822 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1996  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
241 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0822  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
241 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00034623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2952  IstB-like ATP-binding protein  83.82 
 
 
241 aa  424  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  51.3 
 
 
240 aa  268  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  51.3 
 
 
240 aa  268  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  51.3 
 
 
240 aa  268  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  51.3 
 
 
240 aa  268  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  51.3 
 
 
240 aa  268  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2750  IstB-like ATP-binding protein  51.28 
 
 
241 aa  264  8.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.512582  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0026  DNA replication protein  42.61 
 
 
253 aa  202  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0857725  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0708  DNA replication protein  42.61 
 
 
253 aa  202  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.362412  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1801  DNA replication protein  42.61 
 
 
253 aa  202  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272316  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1655  DNA replication protein  42.61 
 
 
253 aa  202  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0316  DNA replication protein  42.61 
 
 
253 aa  202  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.759791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  40.43 
 
 
250 aa  197  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  39.92 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3066  IstB domain protein ATP-binding protein  39.21 
 
 
251 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03380  DNA replication protein  39.74 
 
 
254 aa  185  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.669388  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  42.92 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  42.92 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  42.92 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  42.92 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1413  DNA replication protein  37.87 
 
 
254 aa  179  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1798  AAA-superfamily ATPase  38.1 
 
 
233 aa  178  5.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  37.13 
 
 
261 aa  178  7e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  37.13 
 
 
261 aa  178  7e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  42.23 
 
 
248 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0996  DNA replication protein  37.45 
 
 
261 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.257554  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  38.94 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  38.94 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  38.94 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  37.32 
 
 
221 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  36.67 
 
 
262 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  36.67 
 
 
262 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  36.67 
 
 
262 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  36.67 
 
 
262 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  36.67 
 
 
262 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  36.67 
 
 
262 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  36.67 
 
 
262 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  39.25 
 
 
252 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  39.25 
 
 
252 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  39.25 
 
 
252 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2666  IstB domain protein ATP-binding protein  36.55 
 
 
262 aa  154  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3052  IstB ATP binding domain-containing protein  38.86 
 
 
242 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3391  IstB ATP binding domain-containing protein  38.86 
 
 
242 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  38.86 
 
 
242 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0909  IstB ATP binding domain-containing protein  38.86 
 
 
242 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  38.86 
 
 
242 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.938722  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5399  IstB ATP binding domain-containing protein  38.42 
 
 
242 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5131  IstB ATP binding domain-containing protein  38.86 
 
 
242 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701045  normal  0.85319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2254  IstB ATP binding domain-containing protein  38.42 
 
 
242 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4172  IstB ATP binding domain-containing protein  38.42 
 
 
242 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4981  IstB ATP binding domain-containing protein  38.86 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  40.3 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  40.3 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  33.33 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  38.57 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0565  IstB ATP binding domain-containing protein  38.42 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0923407  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0553  IstB ATP binding domain-containing protein  38.42 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.668205  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0484  IstB-like ATP-binding protein  40.49 
 
 
261 aa  151  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3364  IstB-like ATP-binding protein  40.49 
 
 
261 aa  151  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  36.51 
 
 
268 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0684  IS21 family transposase  42.71 
 
 
264 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  40.49 
 
 
261 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  40.49 
 
 
261 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  42.19 
 
 
268 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3402  IS21 family transposase  42.71 
 
 
264 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1638  IS21 family transposase  42.71 
 
 
264 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3045  IS21 family transposase  42.71 
 
 
264 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488044  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  34.95 
 
 
280 aa  148  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  35.29 
 
 
256 aa  148  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1007  IstB domain protein ATP-binding protein  37.19 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0943  IstB domain protein ATP-binding protein  37.19 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1245  IstB domain protein ATP-binding protein  37.19 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1998  IstB domain protein ATP-binding protein  37.19 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1257  IstB domain protein ATP-binding protein  37.19 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00361337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1255  IstB domain protein ATP-binding protein  37.19 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000529674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0933  IstB domain protein ATP-binding protein  37.19 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0923  IstB domain protein ATP-binding protein  37.19 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  38.46 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  38.42 
 
 
275 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  37.67 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  37.67 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  37.67 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  37.19 
 
 
259 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  37.19 
 
 
259 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  37.19 
 
 
259 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  37.19 
 
 
259 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  35.65 
 
 
257 aa  145  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  35.15 
 
 
281 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  35.15 
 
 
281 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  35.15 
 
 
281 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  40.22 
 
 
265 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  34.17 
 
 
265 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  34.17 
 
 
265 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  34.17 
 
 
265 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  34.17 
 
 
265 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  34.17 
 
 
265 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  34.17 
 
 
265 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  40.22 
 
 
265 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>