More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1702 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
245 aa  497  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  48.56 
 
 
247 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  54.74 
 
 
241 aa  243  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  44.72 
 
 
283 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  48.75 
 
 
270 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  41.39 
 
 
275 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  32.31 
 
 
348 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  32.91 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  35.62 
 
 
426 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  34.93 
 
 
469 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  34.09 
 
 
280 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  34.25 
 
 
470 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  35.52 
 
 
241 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  38.78 
 
 
261 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  35.62 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  30.73 
 
 
345 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  29.92 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  29.02 
 
 
263 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  29.1 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  28.5 
 
 
267 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  28.5 
 
 
267 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  28.5 
 
 
267 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  28.5 
 
 
267 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  29.68 
 
 
327 aa  89.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  35.25 
 
 
312 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  34.9 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  36.99 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  36.99 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  30.8 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  36.99 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  32.9 
 
 
188 aa  85.5  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  39.72 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  26.97 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  34.07 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  32.35 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  0.000000000000115155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  31.51 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  31.51 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  31.51 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  31.51 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  31.51 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  31.51 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  31.51 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  31.51 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  31.51 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  28.11 
 
 
331 aa  82  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  26.75 
 
 
337 aa  82  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  30.47 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  26.17 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  28.08 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  28.08 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  30.5 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  30.5 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  30.5 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  30.5 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  30.5 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  34.33 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  27.78 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  27.66 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  26.61 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2615  DNA replication protein-like protein  34.09 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00158711  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  25.88 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  25.33 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  31.25 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  29.86 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  30.33 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  29.08 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  24.47 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  26.35 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  25 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  29.14 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  25.62 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  30.63 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  30.63 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  30.63 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  30.63 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  30.63 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  24.28 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  30.63 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  33.58 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.370706 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  26.49 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  30.63 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  30.63 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  31.68 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0607  IstB domain protein ATP-binding protein  25.2 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  24 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  24 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0122  primosomal protein DnaI  31.54 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0444634  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1775  primosomal protein DnaI  29.05 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  33.85 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1741  primosomal protein DnaI  29.05 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  32.26 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  28.82 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  30 
 
 
312 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  27.78 
 
 
306 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  28.89 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  26.92 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  27.96 
 
 
334 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  28.12 
 
 
312 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  30.6 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>