More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3956 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 260 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  51 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  35.94 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  37.35 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  34.75 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  34.92 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  34.52 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  34.52 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  33.59 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  33.33 
 
 		 245 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  33.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  33.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  33.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  33.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  33.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  33.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  33.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  32.71 
 
 		 276 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  31.4 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  31.4 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  31.4 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  31.4 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  33.69 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  30.99 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  32.27 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  32.27 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  32.27 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  29.38 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  29.38 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  29.38 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  29.38 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  27.43 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  29.47 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  25.69 
 
 		 248 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  30.43 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  31.72 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  27.36 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  27.75 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  31.21 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  31.36 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  33.07 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  29.89 
 
 		 470 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  27.66 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  26.89 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  27.75 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  26.7 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  32.09 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  25.91 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  31.98 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  31.54 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  31.98 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  31.4 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  30.26 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  31.4 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  28.17 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  34.03 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  29.9 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  25.49 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  30.65 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  32.82 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  27.85 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  25.81 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  27.85 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  26.02 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  33.33 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  27.84 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  27.84 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  28.31 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  31.82 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  26.86 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  28.38 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  26.71 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  27.27 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  27.34 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  26.53 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5104  IstB ATP binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34332 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02457  putative transposase  29.09 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  29.1 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>