More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0230 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0230  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
257 aa  531  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0717  IstB domain protein ATP-binding protein  96.14 
 
 
270 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.254049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0119  IstB domain protein ATP-binding protein  96.14 
 
 
270 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0009  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0077  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0274  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0329  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.627397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0643  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1137  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1280  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.601601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1347  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.917439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1451  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.531328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1556  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0817165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1752  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2042  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000174338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2111  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2173  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2210  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2308  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2320  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000045889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2383  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2567  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0579264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2652  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2659  IstB ATP binding domain-containing protein  90.5 
 
 
278 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1057  IstB ATP binding domain-containing protein  97.14 
 
 
210 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0780  IstB ATP binding domain-containing protein  79.78 
 
 
175 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  35.89 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  35.89 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  35.89 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  35.89 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  35.89 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  35.89 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  35.89 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  36.36 
 
 
265 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2217  IstB ATP binding domain-containing protein  35.07 
 
 
246 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0025  IstB ATP binding domain-containing protein  35.07 
 
 
246 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1297  IstB ATP binding domain-containing protein  35.07 
 
 
246 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  34.93 
 
 
252 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  34.2 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1531  IstB ATP binding domain-containing protein  34.6 
 
 
246 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  34.5 
 
 
266 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  34.5 
 
 
266 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  34.5 
 
 
266 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  32.06 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  32.06 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  30.73 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  30.73 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3716  IstB ATP binding domain-containing protein  33.49 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0109  IstB ATP binding domain-containing protein  33.49 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1008  IstB ATP binding domain-containing protein  33.49 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.126896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1320  IstB ATP binding domain-containing protein  33.49 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2855  IstB ATP binding domain-containing protein  33.49 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  34.65 
 
 
262 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  33.17 
 
 
259 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  33.17 
 
 
259 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  34.65 
 
 
262 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  33.17 
 
 
259 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  34.62 
 
 
221 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1864  IstB domain protein ATP-binding protein  33.97 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  31.58 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  31.58 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  33.65 
 
 
259 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  35.47 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  35.47 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  35.47 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  35.27 
 
 
285 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  35.27 
 
 
285 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1360  IstB ATP binding domain-containing protein  35.75 
 
 
245 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5620  IstB ATP binding domain-containing protein  33.81 
 
 
283 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124688  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2865  IstB domain protein ATP-binding protein  31.86 
 
 
247 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0985234  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  35.27 
 
 
285 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1641  IstB domain protein ATP-binding protein  35.03 
 
 
277 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105498  hitchhiker  0.00131223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  32.99 
 
 
271 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3204  IstB domain protein ATP-binding protein  35.03 
 
 
721 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0227057  hitchhiker  0.0045602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  34.45 
 
 
245 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  31.73 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  32.69 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  30.29 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  30.29 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  30.29 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  30.29 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  30.29 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  30.29 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  32.21 
 
 
291 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  32.21 
 
 
291 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  32.21 
 
 
291 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  32.21 
 
 
291 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  32.21 
 
 
291 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  32.21 
 
 
291 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  32.21 
 
 
291 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  30.88 
 
 
261 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  32.21 
 
 
291 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  32.21 
 
 
291 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  30.88 
 
 
261 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  30.77 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  30.58 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  30.77 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12190  DNA replication protein  34.01 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.748018  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  30.77 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  31.19 
 
 
245 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>