More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1360 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1360  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  49.17 
 
 
252 aa  249  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  42.68 
 
 
257 aa  222  4e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2088  IstB domain protein ATP-binding protein  46.69 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2292  IstB domain protein ATP-binding protein  46.69 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0259  IstB domain protein ATP-binding protein  46.69 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0131  IstB domain protein ATP-binding protein  46.28 
 
 
254 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  40.6 
 
 
252 aa  205  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  40.6 
 
 
252 aa  205  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  40.6 
 
 
252 aa  205  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  41.41 
 
 
252 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  41.41 
 
 
252 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  41.41 
 
 
252 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  41.41 
 
 
252 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1257  IstB ATP binding domain-containing protein  49.15 
 
 
401 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.679289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  38.08 
 
 
259 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  38.08 
 
 
259 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  37.39 
 
 
264 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  38.77 
 
 
262 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  37.39 
 
 
264 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  37.39 
 
 
264 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  37.39 
 
 
264 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  37.39 
 
 
264 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  38.77 
 
 
262 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  38.77 
 
 
262 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  39.21 
 
 
262 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  38.77 
 
 
262 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  38.77 
 
 
262 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  38.77 
 
 
262 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  37.39 
 
 
264 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  37.39 
 
 
264 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  37.82 
 
 
258 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  38.33 
 
 
262 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  37.83 
 
 
265 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  38.33 
 
 
262 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0025  IstB ATP binding domain-containing protein  38.75 
 
 
246 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1297  IstB ATP binding domain-containing protein  38.75 
 
 
246 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2217  IstB ATP binding domain-containing protein  38.75 
 
 
246 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  37.82 
 
 
258 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  37.92 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  38.46 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  38.46 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  38.46 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  36.02 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3716  IstB ATP binding domain-containing protein  37.97 
 
 
258 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0109  IstB ATP binding domain-containing protein  37.97 
 
 
258 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1008  IstB ATP binding domain-containing protein  37.97 
 
 
258 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.126896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1320  IstB ATP binding domain-containing protein  37.97 
 
 
258 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2855  IstB ATP binding domain-containing protein  37.97 
 
 
258 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  36.67 
 
 
271 aa  177  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  37.61 
 
 
280 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  39.83 
 
 
255 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  38.26 
 
 
286 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  38.26 
 
 
286 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  37.81 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5620  IstB ATP binding domain-containing protein  37.6 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124688  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  35.42 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  37.86 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  37.86 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  37.86 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  37.86 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  37.02 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  36.1 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2334  transposase/IS protein  36.1 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  36.1 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  36.1 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  36.52 
 
 
252 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  36.52 
 
 
252 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  36.52 
 
 
252 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  36.52 
 
 
252 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2594  transposase/IS protein  39.92 
 
 
264 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0285671  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2538  transposase/IS protein  40.33 
 
 
264 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000073065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2587  transposase/IS protein  40.33 
 
 
264 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2796  transposase/IS protein  40.33 
 
 
264 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3281  transposase/IS protein  40.33 
 
 
264 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423903  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  36.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>