190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2606 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  34.8 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  32.83 
 
 
264 aa  92.8  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  34.36 
 
 
343 aa  89  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  34.83 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  35.76 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  35.76 
 
 
263 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  36.08 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3580  IstB domain protein ATP-binding protein  33.33 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0305217  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  30.39 
 
 
264 aa  78.2  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  32.75 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  31.51 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  28.65 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  37.19 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  29.32 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  29.8 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  34.06 
 
 
264 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0552  DNA replication protein DnaC  28.78 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000116033  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  28.66 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  28.04 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  31.1 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  30.62 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  29.82 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  25.45 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  25.45 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  27.19 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  25.45 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  25.45 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  26.06 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  32.58 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  28.22 
 
 
426 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  30 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  28.44 
 
 
259 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  28.44 
 
 
259 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  31.82 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  30.22 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  35.83 
 
 
284 aa  62  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  31.45 
 
 
284 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  35.83 
 
 
286 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  32.28 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  27.61 
 
 
470 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  30.89 
 
 
469 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  28.79 
 
 
276 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  31.47 
 
 
245 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  29.19 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  30.16 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  27.67 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  30.41 
 
 
278 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  27.27 
 
 
348 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  34.65 
 
 
297 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  34.65 
 
 
297 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  34.65 
 
 
299 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  28.79 
 
 
259 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  27.23 
 
 
242 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  29.71 
 
 
283 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  31.93 
 
 
313 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5325  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443001 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5450  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.532201 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0041  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4316  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406827  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0085  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0613596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2113  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2975  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.44965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2282  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3083  IstB domain protein ATP-binding protein  28.3 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0167  hypothetical protein  29.6 
 
 
534 aa  53.5  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.381097  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  26.29 
 
 
249 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  26.29 
 
 
249 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  25.4 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  26.29 
 
 
249 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  26.35 
 
 
272 aa  52  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  25 
 
 
252 aa  52  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  31.68 
 
 
293 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  25.86 
 
 
334 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  30.34 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  30.34 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  30.34 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  30.47 
 
 
270 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  30.34 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4484  IstB domain protein ATP-binding protein  28.66 
 
 
248 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0562  AAA ATPase  30.28 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3714  IstB ATP binding domain-containing protein  28.19 
 
 
248 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02457  putative transposase  29.33 
 
 
240 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  27.08 
 
 
249 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  26.46 
 
 
246 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>