71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1274 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1274  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  28.04 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  28.75 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  28.75 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  28.75 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  28.75 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  28.75 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  30.46 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  29.55 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  31.79 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  25.9 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  27.05 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  27.05 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  30.51 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  28.35 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  22.94 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  27.33 
 
 
257 aa  55.1  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  26.23 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  31.45 
 
 
275 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  27.51 
 
 
259 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  28.32 
 
 
264 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  24.55 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  27.17 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  31.3 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  25.71 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  25.66 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  29.55 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  28.14 
 
 
284 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  28.14 
 
 
284 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  27.54 
 
 
286 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  25.27 
 
 
241 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  24.86 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  28.57 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  25.83 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  26.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  26.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  26.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  26.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  26.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  26.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  27.27 
 
 
276 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  24.86 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  24.86 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  26.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  26.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  26.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  27.27 
 
 
276 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0974  chromosomal replication initiator DnaA  27.03 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400417  hitchhiker  0.0000000135124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  26.04 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0809  AAA ATPase  24.12 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000694284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  27.91 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  26.04 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  26.04 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  26.04 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  26.04 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  23.03 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  26.67 
 
 
276 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  26.67 
 
 
276 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  27.41 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  29.1 
 
 
348 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  26.63 
 
 
251 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  25.16 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  26.4 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  25.52 
 
 
334 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  26.4 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  24.24 
 
 
248 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2697  IstB ATP binding domain-containing protein  27.27 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.689881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  27.78 
 
 
345 aa  42  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1057  IstB ATP binding domain-containing protein  28.21 
 
 
210 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0831  DNA replication protein-like protein  26.32 
 
 
272 aa  41.6  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>