More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0493 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00558  predicted transporter  99.52 
 
 		 416 aa  795    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3035  major facilitator superfamily MFS_1  99.28 
 
 		 416 aa  793    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0493  enterobactin exporter EntS  100 
 
 		 416 aa  796    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0751  enterobactin exporter EntS  89.98 
 
 		 414 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0705  enterobactin exporter EntS  90.46 
 
 		 414 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0646  enterobactin exporter EntS  89.98 
 
 		 414 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0642  enterobactin exporter EntS  99.28 
 
 		 416 aa  793    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00547  hypothetical protein  99.52 
 
 		 416 aa  795    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0632  enterobactin exporter EntS  89.98 
 
 		 414 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0611  enterobactin exporter EntS  99.52 
 
 		 416 aa  795    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0689  enterobactin exporter EntS  89.98 
 
 		 414 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.38667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0611  enterobactin exporter EntS  99.28 
 
 		 416 aa  794    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0676  enterobactin exporter EntS  99.52 
 
 		 416 aa  793    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3053  enterobactin exporter EntS  99.28 
 
 		 416 aa  793    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1123  enterobactin exporter EntS  84.8 
 
 		 415 aa  626  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115316  normal  0.860817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3423  enterobactin exporter EntS  64.76 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408147  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  49.52 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  51.09 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  47.98 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  35.99 
 
 		 443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0363  major facilitator superfamily MFS_1  53.01 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  30.6 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  29.49 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  29.52 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  31.73 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 524 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 443 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  28.82 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 443 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  25.69 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1033  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  27.61 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  27.82 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  27.33 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  29.33 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  29.33 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  29.33 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.59 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  27.03 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  28.71 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  26.89 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  27.65 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>