More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0839 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
231 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00842826  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
231 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000039198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0490  ABC transporter, permease protein  89.18 
 
 
231 aa  341  5.999999999999999e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.507412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.81 
 
 
222 aa  275  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.43 
 
 
222 aa  266  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.96 
 
 
222 aa  262  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.74 
 
 
222 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.52 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.29 
 
 
221 aa  198  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.86 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5128  ABC transporter, permease protein  60.83 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0112  ABC transporter, permease protein  60.83 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0198801  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5124  ABC transporter, permease protein  60.37 
 
 
221 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0134076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5126  ABC transporter, permease protein  60.37 
 
 
221 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0592267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5091  ABC transporter, permease protein  60.83 
 
 
221 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4854  ABC transporter permease  60.83 
 
 
223 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4695  ABC transporter, permease  60.83 
 
 
223 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00753221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4710  ABC transporter, permease  60.83 
 
 
223 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5221  ABC transporter permease  60.83 
 
 
221 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.793852  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  51.16 
 
 
224 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.42 
 
 
235 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  47.42 
 
 
235 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.7 
 
 
224 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 
225 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  45.32 
 
 
225 aa  171  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  43.66 
 
 
231 aa  168  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
225 aa  168  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 
224 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 
224 aa  165  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  44.33 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.47 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
217 aa  161  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.76 
 
 
217 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
219 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.48 
 
 
229 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529248  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03420  ABC-type metal ion transport system, permease component  47.12 
 
 
233 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.47 
 
 
221 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
217 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.24 
 
 
229 aa  155  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.799852  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1721  ABC-type metal ion transport system, permease component  41.55 
 
 
232 aa  154  9e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
235 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  46.31 
 
 
217 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  43.54 
 
 
221 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.78 
 
 
218 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  43.54 
 
 
221 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  43.78 
 
 
218 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
236 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  44.93 
 
 
213 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
246 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6305  ABC transporter permease  48.87 
 
 
225 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72630  putative permease of ABC transporter  48.87 
 
 
225 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
221 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  45.32 
 
 
225 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0066  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.23 
 
 
224 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 
224 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  39.34 
 
 
224 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
224 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
226 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
224 aa  148  6e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  42.92 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  43.69 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.08 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0113  ABC transporter, permease protein  48.84 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975917  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.84 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337726  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
225 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
214 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  46.57 
 
 
237 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.35 
 
 
223 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.37 
 
 
223 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00591896  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
214 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
228 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.37 
 
 
217 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
218 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  45.81 
 
 
217 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.14 
 
 
214 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0846  DL-methionine transporter permease subunit  46.31 
 
 
217 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000145183  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  49.76 
 
 
223 aa  143  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00197  DL-methionine transporter subunit  47.29 
 
 
217 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000504385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.29 
 
 
217 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0205  DL-methionine transporter permease subunit  47.29 
 
 
217 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000266103  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  41.01 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  41.01 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  41.01 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0202  DL-methionine transporter permease subunit  47.29 
 
 
217 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  43.84 
 
 
224 aa  142  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0210  DL-methionine transporter permease subunit  47.29 
 
 
217 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147429  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3461  DL-methionine transporter permease subunit  47.29 
 
 
217 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000136309  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  41.01 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00196  hypothetical protein  47.29 
 
 
217 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000400781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  41.01 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  41.01 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0209  DL-methionine transporter permease subunit  47.29 
 
 
217 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00265437  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0343  ABC-type metal ion transport system, permease component  47.42 
 
 
230 aa  141  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000324678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 
225 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  40.95 
 
 
217 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>