211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2903 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
134 aa  269  9e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  64.89 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  70.15 
 
 
135 aa  178  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  64.62 
 
 
133 aa  176  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  64.62 
 
 
133 aa  176  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  63.85 
 
 
133 aa  174  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  59.4 
 
 
134 aa  173  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  63.08 
 
 
133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  60.15 
 
 
135 aa  170  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  60 
 
 
133 aa  167  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  60 
 
 
133 aa  167  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  61.54 
 
 
133 aa  165  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  61.54 
 
 
133 aa  164  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  58.46 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  60 
 
 
133 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  60 
 
 
133 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  60.77 
 
 
135 aa  161  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  61.07 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  59.23 
 
 
133 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  58.46 
 
 
133 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  58.46 
 
 
133 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  61.54 
 
 
133 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  58.46 
 
 
133 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  58.46 
 
 
163 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  56.92 
 
 
133 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  59.54 
 
 
152 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  59.23 
 
 
133 aa  154  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  60 
 
 
133 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  60 
 
 
133 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  59.23 
 
 
133 aa  153  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  49.23 
 
 
140 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  49.24 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  45.04 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  47.58 
 
 
132 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  46.77 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  46.77 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  42.31 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  45.52 
 
 
138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  44.78 
 
 
138 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  44.78 
 
 
138 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  43.08 
 
 
130 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  41.67 
 
 
131 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  40.3 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  45.16 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2437  PTS system fructose subfamily IIA component  47.58 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060686  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  41.22 
 
 
138 aa  107  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0540  PTS system fructose subfamily IIA component  46.77 
 
 
130 aa  105  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 
131 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  62.03 
 
 
82 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 
131 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 
130 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  36.15 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  37.21 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  38.76 
 
 
172 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2849  PTS system fructose subfamily IIA component  46.77 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  43.08 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  37.59 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  36.84 
 
 
133 aa  94  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  37.9 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  35.82 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  33.09 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  34.71 
 
 
136 aa  87  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  34.09 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  42.2 
 
 
129 aa  84.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  36.07 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  35.94 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.58 
 
 
331 aa  74.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  31.25 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  32.33 
 
 
326 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  35.19 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  30 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  30 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  34.68 
 
 
322 aa  70.5  0.000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  31.58 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0564  PTS system fructose subfamily IIA component  31.58 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.576662  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  31.58 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  31.58 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  31.58 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3433  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  31.58 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.67 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.11 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  34.29 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  31.73 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  36.04 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  31.15 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4450  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  30.83 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.236223  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2390  PTS system fructose subfamily IIA component  32 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  35.54 
 
 
318 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3371  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIA component  31.45 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0937  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIA component  31.45 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0989  PTS system fructose subfamily IIA component  31.45 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  32.62 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  33.65 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  33.65 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  32.23 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  32.23 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  32.23 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>