More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2059 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  69.28 
 
 		 181 aa  223  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  70.78 
 
 		 181 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.34 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  50 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  48.94 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  46.54 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.28 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  46.2 
 
 		 222 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  51.09 
 
 		 230 aa  137  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  51.09 
 
 		 230 aa  137  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  50.36 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.95 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.95 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  45.76 
 
 		 208 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  44.38 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  42.7 
 
 		 197 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  44.16 
 
 		 210 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  44.97 
 
 		 206 aa  130  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.1 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  43.64 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  44.16 
 
 		 210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  44.3 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 205 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  42.36 
 
 		 210 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  41.45 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  43.79 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  39.68 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  41.61 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  43.05 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  39.47 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  42.14 
 
 		 221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  38.31 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  36.36 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  41.07 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  42.28 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  43.17 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  43.06 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  41.11 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  39.88 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  42.28 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  40.4 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  42.76 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  37.42 
 
 		 245 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  40.6 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  41.45 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0168  co-chaperone GrpE  34.57 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  38.18 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  38.14 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  35.4 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  36.72 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  36.55 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  38.99 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  38.95 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  38.57 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  37.01 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 213 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  38.59 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  37.74 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  41.21 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  42.55 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  34.64 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  38.59 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  42.67 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  40.51 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  42.03 
 
 		 202 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.44 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>