59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1571 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  26.69 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  26.42 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  26.75 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  27.34 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2592  Choloyl-CoA hydrolase  28.88 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0205084  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  25.88 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  28.12 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  32.04 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  31.39 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  25.1 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  25.48 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1022  acyl-CoA thioesterase  28.1 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  25.3 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.74 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  25.26 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  25.4 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  24.3 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2001  palmitoyl-CoA hydrolase  26.48 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.657953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  28.06 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5814  acyl-CoA thioesterase  26.97 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  29.14 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  23.28 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  26.64 
 
 		 306 aa  45.4  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  29.17 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  24.81 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  24.03 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  26.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  24.03 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  26.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  26.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  26.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  24.03 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  26.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  26.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  26.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  25 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  26.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  24.03 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  25.2 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  26.27 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  23.23 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  23.5 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  30.12 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  26.25 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  25.77 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  29.3 
 
 		 290 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  25.39 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  27.63 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  30.67 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  30.67 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  25.38 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  24.88 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  22.5 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  24.71 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  23.98 
 
 		 282 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  28.57 
 
 		 285 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  27.59 
 
 		 264 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>