37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3672 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 255 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  33.62 
 
 		 1037 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  33.88 
 
 		 2310 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.29 
 
 		 1009 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.28 
 
 		 2305 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.95 
 
 		 891 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.18 
 
 		 1269 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.18 
 
 		 1269 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.43 
 
 		 1340 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.88 
 
 		 1800 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.89 
 
 		 889 aa  75.1  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.89 
 
 		 1113 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.33 
 
 		 928 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.35 
 
 		 1118 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.89 
 
 		 1222 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.55 
 
 		 768 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.35 
 
 		 1225 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.05 
 
 		 1661 aa  62.4  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.79 
 
 		 1012 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.52 
 
 		 2194 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.34 
 
 		 3168 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  27.31 
 
 		 5899 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  30.18 
 
 		 1029 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.58 
 
 		 1180 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.59 
 
 		 1029 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  38.37 
 
 		 4013 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 1598 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  31 
 
 		 5218 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  35.23 
 
 		 3394 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.8 
 
 		 1415 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  27.93 
 
 		 16311 aa  45.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.88 
 
 		 5098 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.45 
 
 		 547 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  36.84 
 
 		 8871 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  27.18 
 
 		 1031 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  28.79 
 
 		 9030 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  31.14 
 
 		 2042 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>